Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DSR2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DSR2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DSR2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DSR2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DSR2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
B4DSR2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DSR2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DSR2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DSR2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DSR2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DSR2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DSR2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DSR2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DSR2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DSR2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DSR2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DSR2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DSR2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DSR2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DSR2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DSR2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DSR2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DSR2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DSR2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DSR2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DSR2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DSR2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DSR2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DSR2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DSR2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DSR2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DSR2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DSR2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DSR2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DSR2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DSR2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DSR2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DSR2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DSR2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DSR2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DSR2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DSR2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DSR2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DSR2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DSR2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DSR2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DSR2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DSR2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DSR2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4DSR2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4DSR2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4DSR2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4DSR2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DSR2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DSR2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DSR2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DSR2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DSR2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DSR2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DSR2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DSR2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DSR2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DSR2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DSR2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DSR2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DSR2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DSR2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DSR2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DSR2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DSR2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
B4DSR2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.32■■□□□ 1
B4DSR2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
B4DSR2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DSR2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DSR2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
B4DSR2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.3■■□□□ 1
B4DSR2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
B4DSR2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
B4DSR2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.29■■□□□ 1
B4DSR2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B4DSR2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B4DSR2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
B4DSR2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B4DSR2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
B4DSR2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B4DSR2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
B4DSR2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
B4DSR2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
B4DSR2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
B4DSR2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B4DSR2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B4DSR2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
B4DSR2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
B4DSR2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
B4DSR2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4DSR2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4DSR2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4DSR2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B4DSR2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms