Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMTNL1A8MU46 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMTNL1A8MU46 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMTNL1A8MU46 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMTNL1A8MU46 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMTNL1A8MU46 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMTNL1A8MU46 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMTNL1A8MU46 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMTNL1A8MU46 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMTNL1A8MU46 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMTNL1A8MU46 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMTNL1A8MU46 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMTNL1A8MU46 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMTNL1A8MU46 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMTNL1A8MU46 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMTNL1A8MU46 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMTNL1A8MU46 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMTNL1A8MU46 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMTNL1A8MU46 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMTNL1A8MU46 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SMTNL1A8MU46 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMTNL1A8MU46 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMTNL1A8MU46 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMTNL1A8MU46 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMTNL1A8MU46 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMTNL1A8MU46 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMTNL1A8MU46 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMTNL1A8MU46 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMTNL1A8MU46 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMTNL1A8MU46 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMTNL1A8MU46 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SMTNL1A8MU46 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMTNL1A8MU46 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMTNL1A8MU46 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMTNL1A8MU46 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMTNL1A8MU46 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMTNL1A8MU46 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMTNL1A8MU46 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMTNL1A8MU46 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.5 ms