Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC0

FAM90A7P, Putative protein FAM90A7P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A7PA6NKC0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM90A7PA6NKC0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM90A7PA6NKC0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM90A7PA6NKC0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM90A7PA6NKC0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM90A7PA6NKC0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM90A7PA6NKC0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM90A7PA6NKC0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM90A7PA6NKC0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM90A7PA6NKC0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM90A7PA6NKC0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM90A7PA6NKC0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM90A7PA6NKC0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms