Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP5A6NIR3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP5A6NIR3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP5A6NIR3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP5A6NIR3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP5A6NIR3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP5A6NIR3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP5A6NIR3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP5A6NIR3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP5A6NIR3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP5A6NIR3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP5A6NIR3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP5A6NIR3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP5A6NIR3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP5A6NIR3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP5A6NIR3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP5A6NIR3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP5A6NIR3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP5A6NIR3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP5A6NIR3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP5A6NIR3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP5A6NIR3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP5A6NIR3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AGAP5A6NIR3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP5A6NIR3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms