Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP69A5D8W1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP69A5D8W1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP69A5D8W1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP69A5D8W1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP69A5D8W1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP69A5D8W1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms