Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J203

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J203 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0B4J203 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0B4J203 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J203 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J203 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J203 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J203 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J203 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J203 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J203 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0B4J203 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0B4J203 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0B4J203 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0B4J203 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0B4J203 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0B4J203 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J203 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A0B4J203 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0B4J203 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0B4J203 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0B4J203 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0B4J203 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0B4J203 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0B4J203 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0B4J203 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0B4J203 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0B4J203 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J203 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J203 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0B4J203 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0B4J203 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0B4J203 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0B4J203 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0B4J203 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms