Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms