Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFLP07196 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFLP07196 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFLP07196 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFLP07196 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFLP07196 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFLP07196 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFLP07196 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFLP07196 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFLP07196 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFLP07196 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFLP07196 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFLP07196 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFLP07196 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFLP07196 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEFLP07196 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEFLP07196 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFLP07196 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFLP07196 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFLP07196 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFLP07196 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFLP07196 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFLP07196 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFLP07196 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFLP07196 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFLP07196 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFLP07196 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFLP07196 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFLP07196 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFLP07196 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFLP07196 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEFLP07196 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFLP07196 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFLP07196 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFLP07196 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFLP07196 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFLP07196 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFLP07196 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFLP07196 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFLP07196 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFLP07196 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFLP07196 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFLP07196 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFLP07196 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFLP07196 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEFLP07196 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFLP07196 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFLP07196 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFLP07196 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFLP07196 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFLP07196 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFLP07196 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFLP07196 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFLP07196 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFLP07196 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFLP07196 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFLP07196 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFLP07196 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEFLP07196 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFLP07196 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFLP07196 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFLP07196 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFLP07196 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFLP07196 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFLP07196 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFLP07196 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFLP07196 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFLP07196 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFLP07196 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFLP07196 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFLP07196 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFLP07196 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFLP07196 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFLP07196 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFLP07196 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEFLP07196 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEFLP07196 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEFLP07196 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEFLP07196 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEFLP07196 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFLP07196 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEFLP07196 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms