Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HIF1AQ16665 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HIF1AQ16665 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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