Protein–RNA interactions for Protein: Q12177

YLL056C, Uncharacterized protein YLL056C, yeastyeast

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL056CQ12177 IES4YOR189W 351 nt1.72□□□□□ -2.13
YLL056CQ12177 SCW11YGL028C 1629 nt1.72□□□□□ -2.13
YLL056CQ12177 YCK3YER123W 1575 nt1.72□□□□□ -2.13
YLL056CQ12177 YLL032CYLL032C 2478 nt1.72□□□□□ -2.13
YLL056CQ12177 MDM20YOL076W 2391 nt1.71□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 NPR2YEL062W 1848 nt1.71□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 snR55snR55 98 nt1.71□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 SWI5YDR146C 2130 nt1.71□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 YLR255CYLR255C 354 nt1.71□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 UBR2YLR024C 5619 nt1.71□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 TDA9YML081W 3756 nt1.7□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.7□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.7□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 PFD1YJL179W 330 nt1.7□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 HIR3YJR140C 4947 nt1.7□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 REV3YPL167C 4515 nt1.69□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 INA22YIR024C 651 nt1.69□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 PAM16YJL104W 450 nt1.69□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 TRX1YLR043C 312 nt1.69□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 CSE2YNR010W 450 nt1.69□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 RPB10YOR210W 213 nt1.69□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 TBS1YBR150C 3285 nt1.69□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 SWI6YLR182W 2412 nt1.68□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 snR72snR72 98 nt1.68□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 PAU2YEL049W 363 nt1.68□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt1.68□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 GPG1YGL121C 381 nt1.68□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 APQ12YIL040W 417 nt1.68□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.68□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 PAU18YLL064C 363 nt1.68□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 INP2YMR163C 2118 nt1.68□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 YNL028WYNL028W 318 nt1.68□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 PAU6YNR076W 363 nt1.68□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 YOR015WYOR015W 360 nt1.68□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 YCL046WYCL046W 324 nt1.68□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 DNF3YMR162C 4971 nt1.68□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 MSC6YOR354C 2079 nt1.68□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 YGL052WYGL052W 306 nt1.67□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.67□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 MUK1YPL070W 1839 nt1.67□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 VIK1YPL253C 1944 nt1.67□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 LCD1YDR499W 2244 nt1.67□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 TRM3YDL112W 4311 nt1.67□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 RFX1YLR176C 2436 nt1.66□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 TMA7YLR262C-A 195 nt1.66□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 COA6YMR244C-A 315 nt1.66□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 YMR321CYMR321C 318 nt1.66□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 YOR302WYOR302W 78 nt1.66□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 SPT21YMR179W 2277 nt1.66□□□□□ -2.14
YLL056CQ12177 YHR210CYHR210C 1026 nt1.65□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 YJR039WYJR039W 3366 nt1.65□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 SEC63YOR254C 1992 nt1.65□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.64□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 IRC20YLR247C 4671 nt1.64□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 TFC8YPL007C 1767 nt1.64□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 LRE1YCL051W 1752 nt1.64□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 LYS14YDR034C 2373 nt1.64□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 MEC1YBR136W 7107 nt1.64□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 ISD11YER048W-A 285 nt1.63□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.63□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 YLR294CYLR294C 330 nt1.63□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 UTP21YLR409C 2820 nt1.63□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 YNL144CYNL144C 2223 nt1.63□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 PDE2YOR360C 1581 nt1.63□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 MPT5YGL178W 2580 nt1.62□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 MSH5YDL154W 2706 nt1.62□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 SEY1YOR165W 2331 nt1.62□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 SRP14YDL092W 441 nt1.62□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.62□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.62□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.62□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 SLY1YDR189W 2001 nt1.62□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 CTR9YOL145C 3234 nt1.62□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 ZRG17YNR039C 1818 nt1.61□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 MSH6YDR097C 3729 nt1.61□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 MYO4YAL029C 4416 nt1.61□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 RLM1YPL089C 2031 nt1.61□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.6□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 VPS54YDR027C 2670 nt1.6□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.6□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt1.6□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.6□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 KIP1YBL063W 3336 nt1.6□□□□□ -2.15
YLL056CQ12177 VPS15YBR097W 4365 nt1.58□□□□□ -2.16
YLL056CQ12177 CAT8YMR280C 4302 nt1.58□□□□□ -2.16
YLL056CQ12177 YJL182CYJL182C 318 nt1.58□□□□□ -2.16
YLL056CQ12177 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.58□□□□□ -2.16
YLL056CQ12177 YPR092WYPR092W 306 nt1.58□□□□□ -2.16
YLL056CQ12177 IRE1YHR079C 3348 nt1.58□□□□□ -2.16
YLL056CQ12177 HSH155YMR288W 2916 nt1.58□□□□□ -2.16
YLL056CQ12177 SPC98YNL126W 2541 nt1.58□□□□□ -2.16
YLL056CQ12177 YGR151CYGR151C 336 nt1.57□□□□□ -2.16
YLL056CQ12177 NUP192YJL039C 5052 nt1.57□□□□□ -2.16
YLL056CQ12177 MAK10YEL053C 2202 nt1.56□□□□□ -2.16
YLL056CQ12177 SFB2YNL049C 2631 nt1.56□□□□□ -2.16
YLL056CQ12177 snR74snR74 88 nt1.56□□□□□ -2.16
YLL056CQ12177 NIP100YPL174C 2607 nt1.56□□□□□ -2.16
YLL056CQ12177 ZIP1YDR285W 2628 nt1.55□□□□□ -2.16
YLL056CQ12177 BRR2YER172C 6492 nt1.55□□□□□ -2.16
YLL056CQ12177 SEC5YDR166C 2916 nt1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12 ms