Protein–RNA interactions for Protein: Q12177

YLL056C, Uncharacterized protein YLL056C, yeastyeast

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL056CQ12177 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.03■□□□□ 0.96
YLL056CQ12177 NSR1YGR159C 1245 nt20.98■□□□□ 0.95
YLL056CQ12177 NOP1YDL014W 984 nt20.39■□□□□ 0.85
YLL056CQ12177 MDJ1YFL016C 1536 nt18.74■□□□□ 0.59
YLL056CQ12177 YKL036CYKL036C 393 nt18.7■□□□□ 0.58
YLL056CQ12177 SRX1YKL086W 384 nt17.8■□□□□ 0.44
YLL056CQ12177 Q0297Q0297 156 nt17.79■□□□□ 0.44
YLL056CQ12177 YJL027CYJL027C 417 nt17.43■□□□□ 0.38
YLL056CQ12177 SCS3YGL126W 1143 nt16.95■□□□□ 0.3
YLL056CQ12177 YCR051WYCR051W 669 nt16.89■□□□□ 0.29
YLL056CQ12177 DBP2YNL112W 1641 nt16.51■□□□□ 0.23
YLL056CQ12177 YOL085CYOL085C 342 nt16.19■□□□□ 0.18
YLL056CQ12177 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.17■□□□□ 0.18
YLL056CQ12177 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.17■□□□□ 0.18
YLL056CQ12177 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.17■□□□□ 0.18
YLL056CQ12177 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.17■□□□□ 0.18
YLL056CQ12177 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.17■□□□□ 0.18
YLL056CQ12177 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.17■□□□□ 0.18
YLL056CQ12177 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.17■□□□□ 0.18
YLL056CQ12177 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.17■□□□□ 0.18
YLL056CQ12177 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.17■□□□□ 0.18
YLL056CQ12177 YBR190WYBR190W 312 nt16.01■□□□□ 0.15
YLL056CQ12177 CCC1YLR220W 969 nt16■□□□□ 0.15
YLL056CQ12177 RPP1BYDL130W 321 nt15.97■□□□□ 0.15
YLL056CQ12177 PKP1YIL042C 1185 nt15.95■□□□□ 0.14
YLL056CQ12177 RTC3YHR087W 336 nt15.66■□□□□ 0.1
YLL056CQ12177 RVS167YDR388W 1449 nt15.54■□□□□ 0.08
YLL056CQ12177 SCJ1YMR214W 1134 nt15.44■□□□□ 0.06
YLL056CQ12177 PET122YER153C 765 nt15.28■□□□□ 0.04
YLL056CQ12177 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.25■□□□□ 0.03
YLL056CQ12177 ATS1YAL020C 1002 nt15.11■□□□□ 0.01
YLL056CQ12177 SCR1SCR1 522 nt15.09■□□□□ 0.01
YLL056CQ12177 SHR5YOL110W 714 nt14.97□□□□□ -0.01
YLL056CQ12177 RRN5YLR141W 1092 nt14.8□□□□□ -0.04
YLL056CQ12177 YDJ1YNL064C 1230 nt14.75□□□□□ -0.05
YLL056CQ12177 URN1YPR152C 1398 nt14.61□□□□□ -0.07
YLL056CQ12177 PUT4YOR348C 1884 nt14.61□□□□□ -0.07
YLL056CQ12177 DEP1YAL013W 1218 nt14.57□□□□□ -0.08
YLL056CQ12177 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.51□□□□□ -0.09
YLL056CQ12177 RSB1YOR049C 1065 nt14.49□□□□□ -0.09
YLL056CQ12177 GAR1YHR089C 618 nt14.44□□□□□ -0.1
YLL056CQ12177 OPI9YLR338W 858 nt14.42□□□□□ -0.1
YLL056CQ12177 RPN10YHR200W 807 nt14.39□□□□□ -0.11
YLL056CQ12177 SAH1YER043C 1350 nt14.36□□□□□ -0.11
YLL056CQ12177 YNL208WYNL208W 600 nt14.34□□□□□ -0.11
YLL056CQ12177 ARE1YCR048W 1833 nt14.31□□□□□ -0.12
YLL056CQ12177 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.16□□□□□ -0.14
YLL056CQ12177 POA1YBR022W 534 nt14.16□□□□□ -0.14
YLL056CQ12177 PUN1YLR414C 792 nt14.02□□□□□ -0.17
YLL056CQ12177 PST2YDR032C 597 nt14.01□□□□□ -0.17
YLL056CQ12177 TIR1YER011W 765 nt13.97□□□□□ -0.17
YLL056CQ12177 YJR018WYJR018W 363 nt13.93□□□□□ -0.18
YLL056CQ12177 BSC6YOL137W 1494 nt13.88□□□□□ -0.19
YLL056CQ12177 SSA3YBL075C 1950 nt13.85□□□□□ -0.19
YLL056CQ12177 PTC2YER089C 1395 nt13.84□□□□□ -0.19
YLL056CQ12177 BUD23YCR047C 828 nt13.82□□□□□ -0.2
YLL056CQ12177 SSA1YAL005C 1929 nt13.81□□□□□ -0.2
YLL056CQ12177 NAB2YGL122C 1578 nt13.69□□□□□ -0.22
YLL056CQ12177 YJR120WYJR120W 351 nt13.68□□□□□ -0.22
YLL056CQ12177 RPP2BYDR382W 333 nt13.64□□□□□ -0.23
YLL056CQ12177 SRB2YHR041C 633 nt13.56□□□□□ -0.24
YLL056CQ12177 FIS1YIL065C 468 nt13.51□□□□□ -0.25
YLL056CQ12177 DAL1YIR027C 1383 nt13.49□□□□□ -0.25
YLL056CQ12177 SHU1YHL006C 453 nt13.47□□□□□ -0.25
YLL056CQ12177 FPR4YLR449W 1179 nt13.46□□□□□ -0.25
YLL056CQ12177 INM2YDR287W 879 nt13.45□□□□□ -0.26
YLL056CQ12177 YKL097CYKL097C 411 nt13.42□□□□□ -0.26
YLL056CQ12177 PHO4YFR034C 939 nt13.38□□□□□ -0.27
YLL056CQ12177 WWM1YFL010C 636 nt13.33□□□□□ -0.28
YLL056CQ12177 BDH2YAL061W 1254 nt13.33□□□□□ -0.28
YLL056CQ12177 YBL100CYBL100C 315 nt13.32□□□□□ -0.28
YLL056CQ12177 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.3□□□□□ -0.28
YLL056CQ12177 YGR021WYGR021W 873 nt13.25□□□□□ -0.29
YLL056CQ12177 SPT5YML010W 3192 nt13.24□□□□□ -0.29
YLL056CQ12177 HOM6YJR139C 1080 nt13.18□□□□□ -0.3
YLL056CQ12177 FUN26YAL022C 1554 nt13.15□□□□□ -0.3
YLL056CQ12177 YPS1YLR120C 1710 nt13.13□□□□□ -0.31
YLL056CQ12177 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.13□□□□□ -0.31
YLL056CQ12177 LSM3YLR438C-A 270 nt13.13□□□□□ -0.31
YLL056CQ12177 MNP1YGL068W 585 nt13.1□□□□□ -0.31
YLL056CQ12177 TRM9YML014W 840 nt13.09□□□□□ -0.31
YLL056CQ12177 YDR095CYDR095C 411 nt13.05□□□□□ -0.32
YLL056CQ12177 MEP2YNL142W 1500 nt13.03□□□□□ -0.32
YLL056CQ12177 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.02□□□□□ -0.33
YLL056CQ12177 ALF1YNL148C 765 nt13□□□□□ -0.33
YLL056CQ12177 RKM5YLR137W 1104 nt12.98□□□□□ -0.33
YLL056CQ12177 CCT6YDR188W 1641 nt12.97□□□□□ -0.33
YLL056CQ12177 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.89□□□□□ -0.35
YLL056CQ12177 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.89□□□□□ -0.35
YLL056CQ12177 YOR139CYOR139C 393 nt12.87□□□□□ -0.35
YLL056CQ12177 SSA4YER103W 1929 nt12.86□□□□□ -0.35
YLL056CQ12177 YOL037CYOL037C 354 nt12.85□□□□□ -0.35
YLL056CQ12177 DCW1YKL046C 1350 nt12.82□□□□□ -0.36
YLL056CQ12177 NPL3YDR432W 1245 nt12.82□□□□□ -0.36
YLL056CQ12177 RPP2AYOL039W 321 nt12.81□□□□□ -0.36
YLL056CQ12177 SIS1YNL007C 1059 nt12.78□□□□□ -0.36
YLL056CQ12177 PTP1YDL230W 1008 nt12.74□□□□□ -0.37
YLL056CQ12177 EMI2YDR516C 1503 nt12.67□□□□□ -0.38
YLL056CQ12177 CAC2YML102W 1407 nt12.64□□□□□ -0.39
YLL056CQ12177 YMR090WYMR090W 684 nt12.6□□□□□ -0.39
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