Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.82□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 YBP1YBR216C 2025 nt1.81□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 YJR011CYJR011C 786 nt1.81□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 RKM1YPL208W 1752 nt1.8□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 ZRG17YNR039C 1818 nt1.8□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 UTP21YLR409C 2820 nt1.8□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 CYC7YEL039C 342 nt1.8□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 YGR265WYGR265W 411 nt1.8□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 YKL136WYKL136W 399 nt1.8□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 SAR1YPL218W 573 nt1.8□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 NUT2YPR168W 474 nt1.8□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 YGR250CYGR250C 2346 nt1.8□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.8□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 IRE1YHR079C 3348 nt1.79□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 MSC6YOR354C 2079 nt1.79□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 CTR9YOL145C 3234 nt1.79□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 YDR102CYDR102C 333 nt1.79□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 ABM1YJR108W 372 nt1.79□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 YKL118WYKL118W 312 nt1.79□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 CFT1YDR301W 4074 nt1.79□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 MAK10YEL053C 2202 nt1.78□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 HIR3YJR140C 4947 nt1.78□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 MYO4YAL029C 4416 nt1.78□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 CSN9YDR179C 489 nt1.78□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 UPS1YLR193C 528 nt1.78□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 RFX1YLR176C 2436 nt1.78□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 ADR1YDR216W 3972 nt1.78□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 LYS14YDR034C 2373 nt1.78□□□□□ -2.12
YBL055CP34220 DCP2YNL118C 2913 nt1.77□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.77□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 YEL057CYEL057C 702 nt1.77□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 SEC63YOR254C 1992 nt1.77□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 SEY1YOR165W 2331 nt1.77□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 HSH155YMR288W 2916 nt1.77□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 YJR039WYJR039W 3366 nt1.76□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.76□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 YOP1YPR028W 543 nt1.76□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 SLY1YDR189W 2001 nt1.76□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 RLM1YPL089C 2031 nt1.75□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.75□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 MSH5YDL154W 2706 nt1.75□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 ZIP1YDR285W 2628 nt1.75□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 YNL144CYNL144C 2223 nt1.74□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 TBS1YBR150C 3285 nt1.74□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 RPL35AYDL191W 363 nt1.74□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.74□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 HMI1YOL095C 2121 nt1.74□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 YSY6YBR162W-A 198 nt1.74□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 snR51snR51 107 nt1.74□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 MUK1YPL070W 1839 nt1.74□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 LHS1YKL073W 2646 nt1.74□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 MSH6YDR097C 3729 nt1.74□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 RIM20YOR275C 1986 nt1.74□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 FRK1YPL141C 2598 nt1.73□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 PKH3YDR466W 2697 nt1.73□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 NHP2YDL208W 471 nt1.73□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.73□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 YHR210CYHR210C 1026 nt1.73□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 RPL38YLR325C 237 nt1.73□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.73□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 YNL146WYNL146W 303 nt1.73□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 BPH1YCR032W 6504 nt1.73□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 MYO2YOR326W 4725 nt1.72□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 PAU3YCR104W 375 nt1.72□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 YDR413CYDR413C 576 nt1.72□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 YHL037CYHL037C 402 nt1.72□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 HTB2YBL002W 396 nt1.72□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 snR36snR36 182 nt1.72□□□□□ -2.13
YBL055CP34220 SRP14YDL092W 441 nt1.71□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 TRX1YLR043C 312 nt1.71□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 MVP1YMR004W 1536 nt1.71□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 YLL032CYLL032C 2478 nt1.71□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 RPB10YOR210W 213 nt1.7□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 MLH3YPL164C 2148 nt1.7□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.69□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.69□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 YER097WYER097W 330 nt1.69□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 YFL032WYFL032W 321 nt1.69□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 PCC1YKR095W-A 267 nt1.69□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 TAR1YLR154W-C 375 nt1.69□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.69□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 IRC20YLR247C 4671 nt1.69□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 INP2YMR163C 2118 nt1.69□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.68□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 YDR426CYDR426C 378 nt1.68□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 COA6YMR244C-A 315 nt1.68□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 MDM20YOL076W 2391 nt1.67□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 NPC2YDL046W 522 nt1.66□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 SAS3YBL052C 2496 nt1.66□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 DGR2YKL121W 2559 nt1.66□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 HSL1YKL101W 4557 nt1.65□□□□□ -2.14
YBL055CP34220 YOR093CYOR093C 4947 nt1.65□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 TRM3YDL112W 4311 nt1.65□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 snR72snR72 98 nt1.65□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 YDR048CYDR048C 315 nt1.65□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 YJL135WYJL135W 318 nt1.65□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.65□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 YOR199WYOR199W 330 nt1.65□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 SFB2YNL049C 2631 nt1.64□□□□□ -2.15
YBL055CP34220 MAM33YIL070C 801 nt1.64□□□□□ -2.15
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