RNA–Protein interactions for RNA: YDL208W

NHP2, Transcript of Protein related to mammalian high mobility group (HMG) proteins, yeastyeast

Gene NHP2, Length 471 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NHP2YDL208W FAP1P53971 965 aa12.32□□□□□ -0.44
NHP2YDL208W MTC1P47018 478 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
NHP2YDL208W PRY3P47033 881 aa11.69□□□□□ -0.54
NHP2YDL208W YCK3P39962 524 aa11.21□□□□□ -0.61
NHP2YDL208W AAD16Q02895 342 aa11.02□□□□□ -0.65
NHP2YDL208W DRS1P32892 752 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
NHP2YDL208W PRI1P10363 409 aa10.94□□□□□ -0.66
NHP2YDL208W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
NHP2YDL208W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
NHP2YDL208W ISW2Q08773 1120 aa10.22□□□□□ -0.77
NHP2YDL208W RPG1P38249 964 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
NHP2YDL208W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
NHP2YDL208W YGL015CP33199 130 aa9.79□□□□□ -0.84
NHP2YDL208W MRPL32P25348 183 aa9.77□□□□□ -0.85
NHP2YDL208W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
NHP2YDL208W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NHP2YDL208W AVT3P36062 692 aa9.36□□□□□ -0.91
NHP2YDL208W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
NHP2YDL208W REB1P21538 810 aa9.28□□□□□ -0.92
NHP2YDL208W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
NHP2YDL208W CDC27P38042 758 aa9.15□□□□□ -0.94
NHP2YDL208W SIS1P25294 352 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
NHP2YDL208W MAP2P38174 421 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
NHP2YDL208W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
NHP2YDL208W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
NHP2YDL208W SPT21P35209 758 aa8.88□□□□□ -0.99
NHP2YDL208W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
NHP2YDL208W UBP9P39967 754 aa8.73□□□□□ -1.01
NHP2YDL208W TFC8Q12308 588 aa8.68□□□□□ -1.02
NHP2YDL208W HOP09932 586 aa8.63□□□□□ -1.03
NHP2YDL208W TGL3P40308 642 aa8.63□□□□□ -1.03
NHP2YDL208W DCD1P06773 312 aa8.57□□□□□ -1.04
NHP2YDL208W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
NHP2YDL208W RIM101P33400 625 aa8.52□□□□□ -1.05
NHP2YDL208W SCY1P53009 804 aa8.52□□□□□ -1.05
NHP2YDL208W SLX5P32828 619 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NHP2YDL208W BCH2P36122 765 aa8.37□□□□□ -1.07
NHP2YDL208W YBL029C-AQ3E756 94 aa8.21□□□□□ -1.1
NHP2YDL208W OXP1P28273 1286 aa8.18□□□□□ -1.1
NHP2YDL208W MST1P07236 462 aa8.17□□□□□ -1.1
NHP2YDL208W EPS1P40557 701 aa8.14□□□□□ -1.11
NHP2YDL208W BDF1P35817 686 aa8.12□□□□□ -1.11
NHP2YDL208W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
NHP2YDL208W VNX1P42839 908 aa8.07□□□□□ -1.12
NHP2YDL208W PTP3P40048 928 aa8.06□□□□□ -1.12
NHP2YDL208W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
NHP2YDL208W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8□□□□□ -1.13 RIP-Chip
NHP2YDL208W YOR238WQ08634 303 aa7.98□□□□□ -1.13
NHP2YDL208W BBC1P47068 1157 aa7.97□□□□□ -1.13
NHP2YDL208W RSM7P47150 247 aa7.97□□□□□ -1.13
NHP2YDL208W FKH1P40466 484 aa7.94□□□□□ -1.14
NHP2YDL208W SPP1Q03012 353 aa7.93□□□□□ -1.14
NHP2YDL208W AI2P03876 854 aa7.91□□□□□ -1.14
NHP2YDL208W TFA1P36100 482 aa7.89□□□□□ -1.15
NHP2YDL208W YAP5P40574 245 aa7.88□□□□□ -1.15
NHP2YDL208W YJL171CP46992 396 aa7.88□□□□□ -1.15
NHP2YDL208W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
NHP2YDL208W WSC3Q12215 556 aa7.82□□□□□ -1.16
NHP2YDL208W TIF11P38912 153 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
NHP2YDL208W YLR271WQ06152 274 aa7.74□□□□□ -1.17
NHP2YDL208W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
NHP2YDL208W BMT6Q12291 365 aa7.7□□□□□ -1.18
NHP2YDL208W GTT3P39996 337 aa7.68□□□□□ -1.18
NHP2YDL208W LDB19Q12502 818 aa7.67□□□□□ -1.18
NHP2YDL208W IOC2Q12072 812 aa7.65□□□□□ -1.18
NHP2YDL208W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data7.6□□□□□ -1.19not detected
NHP2YDL208W MRM1P25270 412 aa7.59□□□□□ -1.19
NHP2YDL208W SSP1P38871 571 aa7.58□□□□□ -1.2
NHP2YDL208W ULI1P43604 169 aa7.58□□□□□ -1.2
NHP2YDL208W MSB4Q12317 492 aa7.56□□□□□ -1.2
NHP2YDL208W PIB1Q06651 286 aa7.53□□□□□ -1.2
NHP2YDL208W EAP1P36041 632 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
NHP2YDL208W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data7.49□□□□□ -1.21not detected
NHP2YDL208W VPS29P38759 282 aa7.46□□□□□ -1.22
NHP2YDL208W MGA2P40578 1113 aa7.46□□□□□ -1.22
NHP2YDL208W RTG3P38165 486 aa7.45□□□□□ -1.22
NHP2YDL208W YOL036WQ08206 761 aa7.44□□□□□ -1.22
NHP2YDL208W DBP1P24784 617 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
NHP2YDL208W CST9Q06032 482 aa7.43□□□□□ -1.22
NHP2YDL208W SET4P42948 560 aa7.41□□□□□ -1.22
NHP2YDL208W RGA2Q06407 1009 aa7.41□□□□□ -1.22
NHP2YDL208W TRP5P00931 707 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
NHP2YDL208W RTG1P32607 177 aa7.4□□□□□ -1.22
NHP2YDL208W SAM3Q08986 587 aa7.4□□□□□ -1.22
NHP2YDL208W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
NHP2YDL208W SEC61P32915 480 aa7.37□□□□□ -1.23
NHP2YDL208W STS1P38637 319 aa7.37□□□□□ -1.23
NHP2YDL208W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NHP2YDL208W NCR1Q12200 1170 aa7.37□□□□□ -1.23
NHP2YDL208W YFR006WP43590 535 aa7.36□□□□□ -1.23
NHP2YDL208W ABP1P15891 592 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
NHP2YDL208W BCK2P33306 851 aa7.3□□□□□ -1.24
NHP2YDL208W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NHP2YDL208W JIP4Q03361 876 aa7.28□□□□□ -1.24
NHP2YDL208W RCR1P38212 213 aa7.27□□□□□ -1.25
NHP2YDL208W DAN4P47179 1161 aa7.25□□□□□ -1.25
NHP2YDL208W GYP5Q12344 894 aa7.25□□□□□ -1.25
NHP2YDL208W HTA1P04911 132 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NHP2YDL208W HTA2P04912 132 aa7.21□□□□□ -1.26
NHP2YDL208W PTC4P38089 393 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.4 ms