Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WASHC2DQ5SRD0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms