Protein–RNA interactions for Protein: Q12104

SWT1, Transcriptional protein SWT1, yeastyeast

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SWT1Q12104 CDC60YPL160W 3273 nt2.07□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 PDR11YIL013C 4236 nt2.07□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 SPF1YEL031W 3648 nt2.06□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 CHC1YGL206C 4962 nt2.06□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 SCP160YJL080C 3669 nt2.06□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.06□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 MAM33YIL070C 801 nt2.06□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 YOR199WYOR199W 330 nt2.06□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 PLC1YPL268W 2610 nt2.06□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 PTP3YER075C 2787 nt2.05□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 SGS1YMR190C 4344 nt2.05□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.05□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 snR36snR36 182 nt2.05□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 SYH1YPL105C 2550 nt2.05□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 NOP53YPL146C 1368 nt2.05□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 PXA2YKL188C 2562 nt2.04□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 COS111YBR203W 2775 nt2.04□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 RPL35AYDL191W 363 nt2.04□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 RPL37BYDR500C 267 nt2.04□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 YFL032WYFL032W 321 nt2.04□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 OSH6YKR003W 1347 nt2.04□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 STE11YLR362W 2154 nt2.04□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.04□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 NEW1YPL226W 3591 nt2.04□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 SVL3YPL032C 2478 nt2.03□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 RGA1YOR127W 3024 nt2.03□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.03□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 SAR1YPL218W 573 nt2.03□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 NUT2YPR168W 474 nt2.03□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 RPH1YER169W 2391 nt2.03□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 UBP1YDL122W 2430 nt2.02□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.02□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.02□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 BRP1YGL007W 378 nt2.02□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 MCM22YJR135C 720 nt2.02□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 PAU18YLL064C 363 nt2.02□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 TMA10YLR327C 261 nt2.02□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.02□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 PAU6YNR076W 363 nt2.02□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 EFR3YMR212C 2349 nt2.02□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 UBP15YMR304W 3693 nt2.02□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 DNA2YHR164C 4569 nt2.01□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 NAM7YMR080C 2916 nt2.01□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 ARP7YPR034W 1434 nt2.01□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 SWI5YDR146C 2130 nt2.01□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.01□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 PEX4YGR133W 552 nt2.01□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 SSQ1YLR369W 1974 nt2.01□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 HDA3YPR179C 1968 nt2.01□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 TAR1YLR154W-C 375 nt2□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 UPS1YLR193C 528 nt2□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 RPL38YLR325C 237 nt2□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 SIR4YDR227W 4077 nt2□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 HER1YOR227W 3741 nt2□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 PDR3YBL005W 2931 nt1.99□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.99□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 CYC7YEL039C 342 nt1.99□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 RPL39YJL189W 156 nt1.99□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.99□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 YCL046WYCL046W 324 nt1.99□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 CAT2YML042W 2013 nt1.99□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 IRC8YJL051W 2469 nt1.99□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 SWI6YLR182W 2412 nt1.99□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 STH1YIL126W 4080 nt1.99□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 PET309YLR067C 2898 nt1.99□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 NAB6YML117W 3405 nt1.98□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 RIM20YOR275C 1986 nt1.98□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 HTB2YBL002W 396 nt1.98□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 STE5YDR103W 2754 nt1.98□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 TFC8YPL007C 1767 nt1.98□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 VPS13YLL040C 9435 nt1.98□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 MSB1YOR188W 3414 nt1.97□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 ATG9YDL149W 2994 nt1.97□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.97□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 YFL063WYFL063W 456 nt1.97□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 PDR8YLR266C 2106 nt1.97□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 BUD2YKL092C 3315 nt1.97□□□□□ -2.09
SWT1Q12104 YER181CYER181C 324 nt1.96□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.96□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 YOP1YPR028W 543 nt1.96□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 LYS14YDR034C 2373 nt1.96□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 MGA2YIR033W 3342 nt1.96□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 SCD5YOR329C 2619 nt1.95□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 YPP1YGR198W 2454 nt1.95□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 RFX1YLR176C 2436 nt1.95□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 snR65snR65 100 nt1.95□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 EMP24YGL200C 612 nt1.95□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.95□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 YML099W-AYML099W-A 330 nt1.95□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 FMP23YBR047W 528 nt1.95□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 snR43snR43 209 nt1.95□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 ZRG17YNR039C 1818 nt1.95□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 DNF1YER166W 4716 nt1.95□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 MVP1YMR004W 1536 nt1.95□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 KOG1YHR186C 4674 nt1.94□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 GCN4YEL009C 846 nt1.94□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 YGR265WYGR265W 411 nt1.94□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.94□□□□□ -2.1
SWT1Q12104 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.2 ms