Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX1Q01196 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms