Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms