Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPRYD3Q8NCJ5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPRYD3Q8NCJ5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms