Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 HSH155YMR288W 2916 nt1.7□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 PBI2YNL015W 228 nt1.7□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 NOP15YNL110C 663 nt1.7□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 RPB11YOL005C 363 nt1.7□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 MDM32YOR147W 1869 nt1.7□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 RPH1YER169W 2391 nt1.7□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 MYO4YAL029C 4416 nt1.69□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 DFG16YOR030W 1860 nt1.69□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.69□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 BNA7YDR428C 786 nt1.69□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 RPI1YIL119C 1224 nt1.69□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 YJR079WYJR079W 330 nt1.69□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.69□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 CTK3YML112W 891 nt1.69□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 GCN2YDR283C 4980 nt1.68□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.68□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 VPS15YBR097W 4365 nt1.68□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 YKL111CYKL111C 336 nt1.68□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 YPL238CYPL238C 390 nt1.68□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 YNL144CYNL144C 2223 nt1.67□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 RIC1YLR039C 3171 nt1.67□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 YER084W-AYER084W-A 513 nt1.67□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 RPC10YHR143W-A 213 nt1.67□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 NUP82YJL061W 2142 nt1.67□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 YDL118WYDL118W 381 nt1.66□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 BTT1YDR252W 450 nt1.66□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.66□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 MXR1YER042W 555 nt1.66□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.66□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 COX7YMR256C 183 nt1.66□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 FYV12YOR183W 390 nt1.66□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 RNH70YGR276C 1662 nt1.66□□□□□ -2.14
PRP46Q12417 NEO1YIL048W 3456 nt1.65□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YJR039WYJR039W 3366 nt1.65□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 PAU3YCR104W 375 nt1.65□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.65□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 NCE101YJL205C 162 nt1.65□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 IRC19YLL033W 693 nt1.65□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 CYB5YNL111C 363 nt1.65□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 AGC1YPR021C 2709 nt1.65□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 VMR1YHL035C 4779 nt1.64□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 RVS161YCR009C 798 nt1.64□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YDL068WYDL068W 330 nt1.64□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 VOA1YGR106C 798 nt1.64□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.64□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YHR130CYHR130C 336 nt1.64□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 TOM22YNL131W 459 nt1.64□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt1.64□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 SPC29YPL124W 762 nt1.64□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 ROX1YPR065W 1107 nt1.64□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 PKH3YDR466W 2697 nt1.64□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 ARP7YPR034W 1434 nt1.64□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 CDC27YBL084C 2277 nt1.64□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.64□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 SEC63YOR254C 1992 nt1.63□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 DIS3YOL021C 3006 nt1.63□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 BIG1YHR101C 1008 nt1.63□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.63□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 AIM29YKR074W 468 nt1.63□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YLR269CYLR269C 351 nt1.63□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 SEN15YMR059W 387 nt1.63□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 SNC2YOR327C 348 nt1.63□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 VPS35YJL154C 2835 nt1.62□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 BI2Q0110 1272 nt1.62□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.62□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YMR324CYMR324C 243 nt1.62□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 snR41snR41 95 nt1.62□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 MUD2YKL074C 1584 nt1.62□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 PLC1YPL268W 2610 nt1.62□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 TFC8YPL007C 1767 nt1.62□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 VPS52YDR484W 1926 nt1.62□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 SHE9YDR393W 1371 nt1.61□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 ASM4YDL088C 1587 nt1.61□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YCR001WYCR001W 315 nt1.61□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 LSO2YGR169C-A 279 nt1.61□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 HSK3YKL138C-A 210 nt1.61□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YLR171WYLR171W 390 nt1.61□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 SYM1YLR251W 594 nt1.61□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YML108WYML108W 318 nt1.61□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.61□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 RTC6YPL183W-A 282 nt1.61□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 IRC10YOL015W 1761 nt1.61□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 PPN1YDR452W 2025 nt1.61□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.6□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YJR157WYJR157W 363 nt1.6□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YOR248WYOR248W 303 nt1.6□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 SAR1YPL218W 573 nt1.6□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 SLM6YBR266C 453 nt1.6□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 VPS34YLR240W 2628 nt1.6□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 DNF3YMR162C 4971 nt1.6□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 SEY1YOR165W 2331 nt1.59□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YGL069CYGL069C 465 nt1.59□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.59□□□□□ -2.15
PRP46Q12417 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.59□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.59□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.59□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 HSL1YKL101W 4557 nt1.59□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 TDA9YML081W 3756 nt1.58□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 YDL041WYDL041W 354 nt1.58□□□□□ -2.16
PRP46Q12417 snR79snR79 84 nt1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.9 ms