Protein–RNA interactions for Protein: Q12329

HSP42, Heat shock protein 42, yeastyeast

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSP42Q12329 YJL016WYJL016W 1686 nt2.11□□□□□ -2.07
HSP42Q12329 LSO2YGR169C-A 279 nt2.1□□□□□ -2.07
HSP42Q12329 CDC53YDL132W 2448 nt2.1□□□□□ -2.07
HSP42Q12329 IRC10YOL015W 1761 nt2.1□□□□□ -2.07
HSP42Q12329 HCS1YKL017C 2052 nt2.1□□□□□ -2.07
HSP42Q12329 VPS35YJL154C 2835 nt2.09□□□□□ -2.07
HSP42Q12329 YJR157WYJR157W 363 nt2.09□□□□□ -2.07
HSP42Q12329 ATP7YKL016C 525 nt2.09□□□□□ -2.07
HSP42Q12329 RPS22BYLR367W 393 nt2.09□□□□□ -2.07
HSP42Q12329 YPR039WYPR039W 336 nt2.09□□□□□ -2.07
HSP42Q12329 snR41snR41 95 nt2.09□□□□□ -2.07
HSP42Q12329 KIP1YBL063W 3336 nt2.09□□□□□ -2.07
HSP42Q12329 CDC50YCR094W 1176 nt2.08□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 HOP2YGL033W 657 nt2.08□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.08□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 MSL1YIR009W 336 nt2.08□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.08□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 PPN1YDR452W 2025 nt2.08□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 CHC1YGL206C 4962 nt2.08□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YNL144CYNL144C 2223 nt2.07□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 GRR1YJR090C 3456 nt2.07□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.07□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.07□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 RPS24AYER074W 408 nt2.07□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 BRP1YGL007W 378 nt2.07□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 HUR1YGL168W 333 nt2.07□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YJL007CYJL007C 315 nt2.07□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 SEC22YLR268W 645 nt2.07□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YNL010WYNL010W 726 nt2.07□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 RUF22RUF22 515 nt2.07□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 SCH9YHR205W 2475 nt2.07□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 VMR1YHL035C 4779 nt2.06□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 MMS22YLR320W 4365 nt2.06□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 RPL37BYDR500C 267 nt2.06□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YGR025WYGR025W 303 nt2.06□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YHR125WYHR125W 306 nt2.06□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YLR053CYLR053C 327 nt2.06□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 DGR1YNL130C-A 147 nt2.06□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 EGD1YPL037C 474 nt2.06□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 TFC3YAL001C 3483 nt2.06□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 STB4YMR019W 2850 nt2.06□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YMR045CYMR045C 5268 nt2.06□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 CDC24YAL041W 2565 nt2.05□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 snR79snR79 84 nt2.05□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.05□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.05□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 HSH155YMR288W 2916 nt2.05□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 SEC31YDL195W 3822 nt2.04□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YDR341CYDR341C 1824 nt2.04□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YER135CYER135C 393 nt2.04□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 CMC2YBL059C-A 330 nt2.04□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 CDC33YOL139C 642 nt2.04□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 snR13snR13 124 nt2.04□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 SYH1YPL105C 2550 nt2.04□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 GCN2YDR283C 4980 nt2.03□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 MGM1YOR211C 2646 nt2.03□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YDR286CYDR286C 345 nt2.03□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 ECL1YGR146C 636 nt2.03□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 NBL1YHR199C-A 222 nt2.03□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt2.03□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.03□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.03□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YAR068WYAR068W 486 nt2.03□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 SNC2YOR327C 348 nt2.03□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 YPL205CYPL205C 345 nt2.03□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 MSS18YPR134W 807 nt2.03□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 NAM7YMR080C 2916 nt2.03□□□□□ -2.08
HSP42Q12329 PKH3YDR466W 2697 nt2.03□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 LRE1YCL051W 1752 nt2.03□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 FAB1YFR019W 6837 nt2.02□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 KAR3YPR141C 2190 nt2.02□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 PET309YLR067C 2898 nt2.02□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 YDR509WYDR509W 348 nt2.02□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 YER121WYER121W 345 nt2.02□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 CRG1YHR209W 876 nt2.02□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 YHR210CYHR210C 1026 nt2.02□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 TSC3YBR058C-A 243 nt2.02□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 snR54snR54 86 nt2.02□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 YFR016CYFR016C 3702 nt2.02□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 UTP22YGR090W 3714 nt2.02□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 LHS1YKL073W 2646 nt2.02□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 UFD4YKL010C 4452 nt2.01□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.01□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 HSK3YKL138C-A 210 nt2.01□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 YLR101CYLR101C 396 nt2.01□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 COX1Q0045 1605 nt2.01□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 DIS3YOL021C 3006 nt2.01□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 SPC72YAL047C 1869 nt2.01□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 GCN4YEL009C 846 nt2□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 YGL069CYGL069C 465 nt2□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 VAR1Q0140 1197 nt2□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 EMP24YGL200C 612 nt2□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 TIF11YMR260C 462 nt2□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 SOK2YMR016C 2358 nt2□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 PEX8YGR077C 1770 nt2□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 GYP5YPL249C 2685 nt1.99□□□□□ -2.09
HSP42Q12329 LYS9YNR050C 1341 nt1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 167.6 ms