Protein–RNA interactions for Protein: Q12089

AEP3, ATPase expression protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AEP3Q12089 SEC16YPL085W 6588 nt2.02□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 VPS52YDR484W 1926 nt2.01□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 CRM1YGR218W 3255 nt2.01□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 YFR016CYFR016C 3702 nt2.01□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 SMB1YER029C 591 nt2.01□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.01□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 YNL122CYNL122C 348 nt2.01□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 SLM6YBR266C 453 nt2.01□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 PDR11YIL013C 4236 nt2.01□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 VPS8YAL002W 3825 nt2□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 MSB1YOR188W 3414 nt2□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 YDL041WYDL041W 354 nt2□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 YER188C-AYER188C-A 300 nt2□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 YGR045CYGR045C 363 nt2□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 YGR290WYGR290W 444 nt2□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 YLR053CYLR053C 327 nt2□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 SIP18YMR175W 240 nt2□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 PBI2YNL015W 228 nt2□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 GPI15YNL038W 690 nt2□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 SNC2YOR327C 348 nt2□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 UFD4YKL010C 4452 nt1.99□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 SPP41YDR464W 4308 nt1.99□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 SOK2YMR016C 2358 nt1.99□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 snR70snR70 164 nt1.99□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 RPL16AYIL133C 600 nt1.99□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 COX7YMR256C 183 nt1.99□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 IRC10YOL015W 1761 nt1.99□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 MGM1YOR211C 2646 nt1.99□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 STB4YMR019W 2850 nt1.98□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 YGR018CYGR018C 330 nt1.98□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 LSO2YGR169C-A 279 nt1.98□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 SEC22YLR268W 645 nt1.98□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 DGR1YNL130C-A 147 nt1.98□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 TFC3YAL001C 3483 nt1.98□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 SHE9YDR393W 1371 nt1.98□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 BUD2YKL092C 3315 nt1.97□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 BUB1YGR188C 3066 nt1.97□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 BIG1YHR101C 1008 nt1.97□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 CDC60YPL160W 3273 nt1.97□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 RIC1YLR039C 3171 nt1.97□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 CDC27YBL084C 2277 nt1.97□□□□□ -2.09
AEP3Q12089 GET1YGL020C 708 nt1.96□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YGL069CYGL069C 465 nt1.96□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 NOP15YNL110C 663 nt1.96□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YOR248WYOR248W 303 nt1.96□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.96□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 SPC29YPL124W 762 nt1.96□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt1.96□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 MUD2YKL074C 1584 nt1.96□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 SCH9YHR205W 2475 nt1.96□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 VMR1YHL035C 4779 nt1.95□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 KAR3YPR141C 2190 nt1.95□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 DNA2YHR164C 4569 nt1.95□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 RPL37BYDR500C 267 nt1.95□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YER084W-AYER084W-A 513 nt1.95□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 HSK3YKL138C-A 210 nt1.95□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 TEN1YLR010C 483 nt1.95□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 DDR48YMR173W 1293 nt1.95□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 ATP19YOL077W-A 207 nt1.95□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YDR341CYDR341C 1824 nt1.95□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 RNH70YGR276C 1662 nt1.95□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 SYH1YPL105C 2550 nt1.95□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 ATG9YDL149W 2994 nt1.95□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 PPN1YDR452W 2025 nt1.95□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 NEO1YIL048W 3456 nt1.94□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YDL062WYDL062W 426 nt1.94□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 snR79snR79 84 nt1.94□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt1.94□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt1.94□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YKR051WYKR051W 1257 nt1.94□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 FYV7YLR068W 456 nt1.94□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 GPX2YBR244W 489 nt1.94□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 GRR1YJR090C 3456 nt1.94□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 UBP1YDL122W 2430 nt1.93□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 SGD1YLR336C 2700 nt1.93□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 CHC1YGL206C 4962 nt1.93□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YDL032WYDL032W 312 nt1.93□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 MXR1YER042W 555 nt1.93□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YER121WYER121W 345 nt1.93□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 COX13YGL191W 390 nt1.93□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YHR130CYHR130C 336 nt1.93□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YPR039WYPR039W 336 nt1.93□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 CAT2YML042W 2013 nt1.93□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 CDC24YAL041W 2565 nt1.93□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 PDR8YLR266C 2106 nt1.93□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 PDR3YBL005W 2931 nt1.92□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YDL118WYDL118W 381 nt1.92□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 PSY1YKL076C 384 nt1.92□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 AGC1YPR021C 2709 nt1.92□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YLR149CYLR149C 2193 nt1.92□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1.91□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 MATALPHA2YCR039C 633 nt1.91□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 IES5YER092W 378 nt1.91□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YML084WYML084W 309 nt1.91□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 snR43snR43 209 nt1.91□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 SET2YJL168C 2202 nt1.91□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 TMN3YER113C 2121 nt1.91□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 NOT5YPR072W 1683 nt1.9□□□□□ -2.1
AEP3Q12089 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.9□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.8 ms