Protein–RNA interactions for Protein: P29056

BRF1, Transcription factor IIIB 70 kDa subunit, yeastyeast

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRF1P29056 TIM8YJR135W-A 264 nt2.19□□□□□ -2.06
BRF1P29056 HER1YOR227W 3741 nt2.19□□□□□ -2.06
BRF1P29056 CFT2YLR115W 2580 nt2.18□□□□□ -2.06
BRF1P29056 CDC60YPL160W 3273 nt2.18□□□□□ -2.06
BRF1P29056 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.18□□□□□ -2.06
BRF1P29056 GCN4YEL009C 846 nt2.18□□□□□ -2.06
BRF1P29056 MTC7YEL033W 420 nt2.18□□□□□ -2.06
BRF1P29056 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.18□□□□□ -2.06
BRF1P29056 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.18□□□□□ -2.06
BRF1P29056 NUP120YKL057C 3114 nt2.18□□□□□ -2.06
BRF1P29056 UTP22YGR090W 3714 nt2.17□□□□□ -2.06
BRF1P29056 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.17□□□□□ -2.06
BRF1P29056 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.17□□□□□ -2.06
BRF1P29056 NEO1YIL048W 3456 nt2.17□□□□□ -2.06
BRF1P29056 TAE2YPL009C 3117 nt2.17□□□□□ -2.06
BRF1P29056 TFC3YAL001C 3483 nt2.16□□□□□ -2.06
BRF1P29056 CDC53YDL132W 2448 nt2.16□□□□□ -2.06
BRF1P29056 YAP3YHL009C 993 nt2.16□□□□□ -2.06
BRF1P29056 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.16□□□□□ -2.06
BRF1P29056 BNA7YDR428C 786 nt2.15□□□□□ -2.07
BRF1P29056 BRP1YGL007W 378 nt2.15□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YGR290WYGR290W 444 nt2.15□□□□□ -2.07
BRF1P29056 RPS22BYLR367W 393 nt2.15□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YML084WYML084W 309 nt2.15□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YOR333CYOR333C 417 nt2.15□□□□□ -2.07
BRF1P29056 IRC16YPR038W 360 nt2.15□□□□□ -2.07
BRF1P29056 NUP82YJL061W 2142 nt2.15□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.15□□□□□ -2.07
BRF1P29056 ALK2YBL009W 2031 nt2.15□□□□□ -2.07
BRF1P29056 MNE1YOR350C 1992 nt2.14□□□□□ -2.07
BRF1P29056 SCH9YHR205W 2475 nt2.14□□□□□ -2.07
BRF1P29056 AGC1YPR021C 2709 nt2.14□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YDL068WYDL068W 330 nt2.14□□□□□ -2.07
BRF1P29056 COX13YGL191W 390 nt2.14□□□□□ -2.07
BRF1P29056 NOP10YHR072W-A 177 nt2.14□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.14□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.14□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YLR031WYLR031W 561 nt2.14□□□□□ -2.07
BRF1P29056 CTK3YML112W 891 nt2.14□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YNL122CYNL122C 348 nt2.14□□□□□ -2.07
BRF1P29056 ROX1YPR065W 1107 nt2.14□□□□□ -2.07
BRF1P29056 HCS1YKL017C 2052 nt2.14□□□□□ -2.07
BRF1P29056 GRR1YJR090C 3456 nt2.13□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.13□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YGR045CYGR045C 363 nt2.13□□□□□ -2.07
BRF1P29056 SMD1YGR074W 441 nt2.13□□□□□ -2.07
BRF1P29056 MSL1YIR009W 336 nt2.13□□□□□ -2.07
BRF1P29056 NCE101YJL205C 162 nt2.13□□□□□ -2.07
BRF1P29056 SNC1YAL030W 354 nt2.13□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YJR079WYJR079W 330 nt2.13□□□□□ -2.07
BRF1P29056 GRX8YLR364W 330 nt2.13□□□□□ -2.07
BRF1P29056 PKR1YMR123W 369 nt2.13□□□□□ -2.07
BRF1P29056 MRPL44YMR225C 297 nt2.13□□□□□ -2.07
BRF1P29056 BFA1YJR053W 1725 nt2.13□□□□□ -2.07
BRF1P29056 DFG16YOR030W 1860 nt2.12□□□□□ -2.07
BRF1P29056 CDC50YCR094W 1176 nt2.12□□□□□ -2.07
BRF1P29056 MZM1YDR493W 372 nt2.12□□□□□ -2.07
BRF1P29056 GPI15YNL038W 690 nt2.12□□□□□ -2.07
BRF1P29056 GCN2YDR283C 4980 nt2.12□□□□□ -2.07
BRF1P29056 PEX8YGR077C 1770 nt2.12□□□□□ -2.07
BRF1P29056 MGM1YOR211C 2646 nt2.11□□□□□ -2.07
BRF1P29056 SMB1YER029C 591 nt2.11□□□□□ -2.07
BRF1P29056 VOA1YGR106C 798 nt2.11□□□□□ -2.07
BRF1P29056 RPC10YHR143W-A 213 nt2.11□□□□□ -2.07
BRF1P29056 RPL16AYIL133C 600 nt2.11□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YKL111CYKL111C 336 nt2.11□□□□□ -2.07
BRF1P29056 SEN15YMR059W 387 nt2.11□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YNL010WYNL010W 726 nt2.11□□□□□ -2.07
BRF1P29056 BRE1YDL074C 2103 nt2.11□□□□□ -2.07
BRF1P29056 DIS3YOL021C 3006 nt2.1□□□□□ -2.07
BRF1P29056 EMP24YGL200C 612 nt2.1□□□□□ -2.07
BRF1P29056 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.1□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YLR053CYLR053C 327 nt2.1□□□□□ -2.07
BRF1P29056 PBI2YNL015W 228 nt2.1□□□□□ -2.07
BRF1P29056 MSS18YPR134W 807 nt2.1□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.1□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.1□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.1□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YJL016WYJL016W 1686 nt2.09□□□□□ -2.07
BRF1P29056 SPO22YIL073C 2928 nt2.09□□□□□ -2.07
BRF1P29056 RPL37BYDR500C 267 nt2.09□□□□□ -2.07
BRF1P29056 IRC19YLL033W 693 nt2.09□□□□□ -2.07
BRF1P29056 DGR1YNL130C-A 147 nt2.09□□□□□ -2.07
BRF1P29056 RPB5YBR154C 648 nt2.09□□□□□ -2.07
BRF1P29056 YMR045CYMR045C 5268 nt2.09□□□□□ -2.08
BRF1P29056 FKS1YLR342W 5631 nt2.08□□□□□ -2.08
BRF1P29056 BIG1YHR101C 1008 nt2.08□□□□□ -2.08
BRF1P29056 YHR130CYHR130C 336 nt2.08□□□□□ -2.08
BRF1P29056 NOP15YNL110C 663 nt2.08□□□□□ -2.08
BRF1P29056 ATP19YOL077W-A 207 nt2.08□□□□□ -2.08
BRF1P29056 YPL068CYPL068C 882 nt2.08□□□□□ -2.08
BRF1P29056 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.08□□□□□ -2.08
BRF1P29056 SLM6YBR266C 453 nt2.08□□□□□ -2.08
BRF1P29056 LRE1YCL051W 1752 nt2.08□□□□□ -2.08
BRF1P29056 KOG1YHR186C 4674 nt2.08□□□□□ -2.08
BRF1P29056 VPS35YJL154C 2835 nt2.07□□□□□ -2.08
BRF1P29056 RNH70YGR276C 1662 nt2.07□□□□□ -2.08
BRF1P29056 MXR1YER042W 555 nt2.07□□□□□ -2.08
BRF1P29056 TEN1YLR010C 483 nt2.07□□□□□ -2.08
BRF1P29056 FYV7YLR068W 456 nt2.07□□□□□ -2.08
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