Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNPLA3Q9NST1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNPLA3Q9NST1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNPLA3Q9NST1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNPLA3Q9NST1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNPLA3Q9NST1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNPLA3Q9NST1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNPLA3Q9NST1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNPLA3Q9NST1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNPLA3Q9NST1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNPLA3Q9NST1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNPLA3Q9NST1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PNPLA3Q9NST1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PNPLA3Q9NST1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms