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Protein–RNA interactions for Protein: Q12241
VAM3, Syntaxin VAM3, yeast
Predictions only
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283 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
VAM3
Q12241
YGR018C
YGR018C
330 nt
2.18
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YLR031W
YLR031W
561 nt
2.18
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
RMP1
YLR145W
606 nt
2.18
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YLR154W-E
YLR154W-E
204 nt
2.18
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
NUP82
YJL061W
2142 nt
2.18
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
MPH1
YIR002C
2982 nt
2.17
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
RAV1
YJR033C
4074 nt
2.17
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
TAE2
YPL009C
3117 nt
2.17
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
COX13
YGL191W
390 nt
2.17
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
RPS17A
YML024W
411 nt
2.17
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
DDR48
YMR173W
1293 nt
2.17
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YNL010W
YNL010W
726 nt
2.17
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YBR076C-A
YBR076C-A
267 nt
2.17
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
DAD3
YBR233W-A
285 nt
2.17
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
SKP2
YNL311C
2292 nt
2.17
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
FKS3
YMR306W
5358 nt
2.17
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
UBR1
YGR184C
5853 nt
2.17
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
PDR1
YGL013C
3207 nt
2.17
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
MLH1
YMR167W
2310 nt
2.17
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
SGS1
YMR190C
4344 nt
2.16
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
STH1
YIL126W
4080 nt
2.16
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
MZM1
YDR493W
372 nt
2.16
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YEL030C-A
YEL030C-A
315 nt
2.16
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
RPC10
YHR143W-A
213 nt
2.16
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
NCE101
YJL205C
162 nt
2.16
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YKR051W
YKR051W
1257 nt
2.16
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
PRE8
YML092C
753 nt
2.16
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
SEN15
YMR059W
387 nt
2.16
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YPL276W
YPL276W
438 nt
2.16
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
SLM6
YBR266C
453 nt
2.16
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YBR012W-A
YBR012W-A
1323 nt
2.16
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YOR142W-A
YOR142W-A
1323 nt
2.16
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YPR158W-A
YPR158W-A
1323 nt
2.16
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
YJL016W
YJL016W
1686 nt
2.15
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
IPT1
YDR072C
1584 nt
2.15
□□□□□ -2.06
VAM3
Q12241
tW(CCA)G1
tW(CCA)G1
72 nt
2.15
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
tW(CCA)G2
tW(CCA)G2
72 nt
2.15
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
tW(CCA)J
tW(CCA)J
72 nt
2.15
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
tW(CCA)K
tW(CCA)K
72 nt
2.15
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
tW(CCA)M
tW(CCA)M
72 nt
2.15
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
tW(CCA)P
tW(CCA)P
72 nt
2.15
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
BET3
YKR068C
582 nt
2.15
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
YLR154W-A
YLR154W-A
186 nt
2.15
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
VPS20
YMR077C
666 nt
2.15
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
VTI1
YMR197C
654 nt
2.15
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
YOR055W
YOR055W
435 nt
2.15
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
ROX1
YPR065W
1107 nt
2.15
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
SVL3
YPL032C
2478 nt
2.15
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
CDC50
YCR094W
1176 nt
2.14
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
YER084W-A
YER084W-A
513 nt
2.14
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
RPF1
YHR088W
888 nt
2.14
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
tT(UGU)Q1
tT(UGU)Q1
76 nt
2.14
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
RPI1
YIL119C
1224 nt
2.14
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
AYR1
YIL124W
894 nt
2.14
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
IRC19
YLL033W
693 nt
2.14
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
GRX8
YLR364W
330 nt
2.14
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
SAS2
YMR127C
1017 nt
2.14
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
SIP18
YMR175W
240 nt
2.14
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
YOR050C
YOR050C
348 nt
2.14
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
BFA1
YJR053W
1725 nt
2.14
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
VOA1
YGR106C
798 nt
2.13
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
NOP10
YHR072W-A
177 nt
2.13
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
SNC1
YAL030W
354 nt
2.13
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
UTP30
YKR060W
825 nt
2.13
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
YLR171W
YLR171W
390 nt
2.13
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
ASM4
YDL088C
1587 nt
2.13
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
GIP3
YPL137C
3831 nt
2.13
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
AFI1
YOR129C
2682 nt
2.13
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
YOL098C
YOL098C
3114 nt
2.13
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
RSE1
YML049C
4086 nt
2.12
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
BI2
Q0110
1272 nt
2.12
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
YER188C-A
YER188C-A
300 nt
2.12
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
MSL1
YIR009W
336 nt
2.12
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
YML108W
YML108W
318 nt
2.12
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
RSA1
YPL193W
1146 nt
2.12
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
PTP3
YER075C
2787 nt
2.12
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
YOR192C-A
YOR192C-A
1317 nt
2.12
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
RNH70
YGR276C
1662 nt
2.12
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
SMD1
YGR074W
441 nt
2.11
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
YHR032W-A
YHR032W-A
180 nt
2.11
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
UBP15
YMR304W
3693 nt
2.11
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
CDC53
YDL132W
2448 nt
2.11
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
NEW1
YPL226W
3591 nt
2.11
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
CLN3
YAL040C
1743 nt
2.11
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
SEC16
YPL085W
6588 nt
2.1
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
KAP123
YER110C
3342 nt
2.1
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
YCR001W
YCR001W
315 nt
2.1
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
SYM1
YLR251W
594 nt
2.1
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
PEX17
YNL214W
600 nt
2.1
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
YOR032W-A
YOR032W-A
201 nt
2.1
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
YOR248W
YOR248W
303 nt
2.1
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
VPS52
YDR484W
1926 nt
2.1
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
YPR097W
YPR097W
3222 nt
2.1
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
PDR11
YIL013C
4236 nt
2.1
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
snR70
snR70
164 nt
2.09
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
YDL041W
YDL041W
354 nt
2.09
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
EMC6
YLL014W
327 nt
2.09
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
YMR324C
YMR324C
243 nt
2.09
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
RPB5
YBR154C
648 nt
2.09
□□□□□ -2.07
VAM3
Q12241
VMA9
YCL005W-A
222 nt
2.09
□□□□□ -2.07
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