Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 NSR1YGR159C 1245 nt17.17■□□□□ 0.34
VAM3Q12241 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.04■□□□□ 0.32
VAM3Q12241 NOP1YDL014W 984 nt16.56■□□□□ 0.24
VAM3Q12241 MDJ1YFL016C 1536 nt15.57■□□□□ 0.08
VAM3Q12241 YKL036CYKL036C 393 nt15.14■□□□□ 0.01
VAM3Q12241 SRX1YKL086W 384 nt14.45□□□□□ -0.1
VAM3Q12241 Q0297Q0297 156 nt14.44□□□□□ -0.1
VAM3Q12241 YJL027CYJL027C 417 nt14.39□□□□□ -0.11
VAM3Q12241 SCS3YGL126W 1143 nt13.68□□□□□ -0.22
VAM3Q12241 YCR051WYCR051W 669 nt13.67□□□□□ -0.22
VAM3Q12241 DBP2YNL112W 1641 nt13.6□□□□□ -0.23
VAM3Q12241 YBR190WYBR190W 312 nt13.45□□□□□ -0.26
VAM3Q12241 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.14□□□□□ -0.31
VAM3Q12241 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.14□□□□□ -0.31
VAM3Q12241 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.14□□□□□ -0.31
VAM3Q12241 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.14□□□□□ -0.31
VAM3Q12241 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.14□□□□□ -0.31
VAM3Q12241 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.14□□□□□ -0.31
VAM3Q12241 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.14□□□□□ -0.31
VAM3Q12241 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.14□□□□□ -0.31
VAM3Q12241 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.14□□□□□ -0.31
VAM3Q12241 RTC3YHR087W 336 nt13.11□□□□□ -0.31
VAM3Q12241 YOL085CYOL085C 342 nt13.1□□□□□ -0.31
VAM3Q12241 CCC1YLR220W 969 nt12.96□□□□□ -0.33
VAM3Q12241 RPP1BYDL130W 321 nt12.95□□□□□ -0.34
VAM3Q12241 PKP1YIL042C 1185 nt12.88□□□□□ -0.35
VAM3Q12241 RVS167YDR388W 1449 nt12.79□□□□□ -0.36
VAM3Q12241 SSA3YBL075C 1950 nt12.71□□□□□ -0.37
VAM3Q12241 SCJ1YMR214W 1134 nt12.54□□□□□ -0.4
VAM3Q12241 PUT4YOR348C 1884 nt12.48□□□□□ -0.41
VAM3Q12241 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.38□□□□□ -0.43
VAM3Q12241 PET122YER153C 765 nt12.36□□□□□ -0.43
VAM3Q12241 SCR1SCR1 522 nt12.24□□□□□ -0.45
VAM3Q12241 SHR5YOL110W 714 nt12.22□□□□□ -0.45
VAM3Q12241 ATS1YAL020C 1002 nt12.21□□□□□ -0.45
VAM3Q12241 ARE1YCR048W 1833 nt12.13□□□□□ -0.47
VAM3Q12241 URN1YPR152C 1398 nt12.11□□□□□ -0.47
VAM3Q12241 POA1YBR022W 534 nt12.06□□□□□ -0.48
VAM3Q12241 SAH1YER043C 1350 nt12.04□□□□□ -0.48
VAM3Q12241 OPI9YLR338W 858 nt12.03□□□□□ -0.48
VAM3Q12241 YDJ1YNL064C 1230 nt12□□□□□ -0.49
VAM3Q12241 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.99□□□□□ -0.49
VAM3Q12241 RRN5YLR141W 1092 nt11.99□□□□□ -0.49
VAM3Q12241 DEP1YAL013W 1218 nt11.95□□□□□ -0.5
VAM3Q12241 RPN10YHR200W 807 nt11.9□□□□□ -0.5
VAM3Q12241 BSC6YOL137W 1494 nt11.89□□□□□ -0.51
VAM3Q12241 YNL208WYNL208W 600 nt11.78□□□□□ -0.52
VAM3Q12241 Q0182Q0182 405 nt11.77□□□□□ -0.53
VAM3Q12241 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.76□□□□□ -0.53
VAM3Q12241 GAR1YHR089C 618 nt11.71□□□□□ -0.53
VAM3Q12241 PUN1YLR414C 792 nt11.71□□□□□ -0.53
VAM3Q12241 RSB1YOR049C 1065 nt11.71□□□□□ -0.53
VAM3Q12241 BUD23YCR047C 828 nt11.68□□□□□ -0.54
VAM3Q12241 SPT5YML010W 3192 nt11.6□□□□□ -0.55
VAM3Q12241 PTC2YER089C 1395 nt11.59□□□□□ -0.55
VAM3Q12241 NAB2YGL122C 1578 nt11.54□□□□□ -0.56
VAM3Q12241 YJR018WYJR018W 363 nt11.53□□□□□ -0.56
VAM3Q12241 SSA4YER103W 1929 nt11.43□□□□□ -0.58
VAM3Q12241 TIR1YER011W 765 nt11.35□□□□□ -0.59
VAM3Q12241 PST2YDR032C 597 nt11.33□□□□□ -0.6
VAM3Q12241 DAL1YIR027C 1383 nt11.29□□□□□ -0.6
VAM3Q12241 FIS1YIL065C 468 nt11.28□□□□□ -0.6
VAM3Q12241 SSA1YAL005C 1929 nt11.25□□□□□ -0.61
VAM3Q12241 RPP2BYDR382W 333 nt11.24□□□□□ -0.61
VAM3Q12241 FPS1YLL043W 2010 nt11.23□□□□□ -0.61
VAM3Q12241 FPR4YLR449W 1179 nt11.23□□□□□ -0.61
VAM3Q12241 MEP2YNL142W 1500 nt11.21□□□□□ -0.61
VAM3Q12241 INM2YDR287W 879 nt11.21□□□□□ -0.61
VAM3Q12241 YJR120WYJR120W 351 nt11.2□□□□□ -0.62
VAM3Q12241 MOT3YMR070W 1473 nt11.18□□□□□ -0.62
VAM3Q12241 PHO4YFR034C 939 nt11.17□□□□□ -0.62
VAM3Q12241 NVJ2YPR091C 2313 nt11.14□□□□□ -0.63
VAM3Q12241 YPS1YLR120C 1710 nt11.1□□□□□ -0.63
VAM3Q12241 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.02□□□□□ -0.65
VAM3Q12241 YBL100CYBL100C 315 nt11.01□□□□□ -0.65
VAM3Q12241 BDF1YLR399C 2061 nt11□□□□□ -0.65
VAM3Q12241 DCW1YKL046C 1350 nt10.99□□□□□ -0.65
VAM3Q12241 SRB2YHR041C 633 nt10.98□□□□□ -0.65
VAM3Q12241 PAC11YDR488C 1602 nt10.98□□□□□ -0.65
VAM3Q12241 YDR095CYDR095C 411 nt10.97□□□□□ -0.65
VAM3Q12241 BDH2YAL061W 1254 nt10.91□□□□□ -0.66
VAM3Q12241 YMR090WYMR090W 684 nt10.9□□□□□ -0.66
VAM3Q12241 SHU1YHL006C 453 nt10.88□□□□□ -0.67
VAM3Q12241 EMI2YDR516C 1503 nt10.87□□□□□ -0.67
VAM3Q12241 TAT1YBR069C 1860 nt10.87□□□□□ -0.67
VAM3Q12241 FUN26YAL022C 1554 nt10.86□□□□□ -0.67
VAM3Q12241 ALF1YNL148C 765 nt10.83□□□□□ -0.68
VAM3Q12241 YKL097CYKL097C 411 nt10.81□□□□□ -0.68
VAM3Q12241 WWM1YFL010C 636 nt10.8□□□□□ -0.68
VAM3Q12241 YBR220CYBR220C 1683 nt10.79□□□□□ -0.68
VAM3Q12241 TRM9YML014W 840 nt10.79□□□□□ -0.68
VAM3Q12241 RPP2AYOL039W 321 nt10.78□□□□□ -0.68
VAM3Q12241 YDL221WYDL221W 552 nt10.76□□□□□ -0.69
VAM3Q12241 YGR021WYGR021W 873 nt10.75□□□□□ -0.69
VAM3Q12241 PTP1YDL230W 1008 nt10.72□□□□□ -0.69
VAM3Q12241 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.72□□□□□ -0.69
VAM3Q12241 SDH1YKL148C 1923 nt10.71□□□□□ -0.69
VAM3Q12241 LSM3YLR438C-A 270 nt10.71□□□□□ -0.69
VAM3Q12241 CAC2YML102W 1407 nt10.69□□□□□ -0.7
VAM3Q12241 CCT6YDR188W 1641 nt10.69□□□□□ -0.7
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