Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QLW9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
J3QLW9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
J3QLW9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
J3QLW9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
J3QLW9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
J3QLW9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
J3QLW9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QLW9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QLW9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QLW9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QLW9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QLW9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QLW9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QLW9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QLW9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QLW9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QLW9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QLW9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QLW9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QLW9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
J3QLW9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
J3QLW9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms