Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
U3KQV3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
U3KQV3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
U3KQV3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
U3KQV3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U3KQV3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U3KQV3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
U3KQV3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
U3KQV3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQV3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQV3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQV3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQV3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U3KQV3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U3KQV3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U3KQV3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U3KQV3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U3KQV3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U3KQV3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U3KQV3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U3KQV3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U3KQV3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U3KQV3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U3KQV3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U3KQV3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
U3KQV3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U3KQV3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
U3KQV3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U3KQV3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
U3KQV3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U3KQV3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U3KQV3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
U3KQV3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
U3KQV3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
U3KQV3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
U3KQV3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
U3KQV3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
U3KQV3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
U3KQV3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U3KQV3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U3KQV3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U3KQV3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U3KQV3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U3KQV3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U3KQV3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U3KQV3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
U3KQV3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
U3KQV3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U3KQV3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U3KQV3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U3KQV3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U3KQV3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U3KQV3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U3KQV3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U3KQV3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U3KQV3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U3KQV3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U3KQV3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U3KQV3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U3KQV3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U3KQV3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U3KQV3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U3KQV3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U3KQV3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
U3KQV3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U3KQV3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U3KQV3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U3KQV3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U3KQV3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
U3KQV3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U3KQV3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U3KQV3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
U3KQV3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U3KQV3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U3KQV3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U3KQV3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U3KQV3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U3KQV3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U3KQV3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U3KQV3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U3KQV3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U3KQV3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U3KQV3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U3KQV3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U3KQV3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U3KQV3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U3KQV3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U3KQV3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U3KQV3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U3KQV3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U3KQV3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U3KQV3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U3KQV3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U3KQV3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U3KQV3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
U3KQV3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U3KQV3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U3KQV3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U3KQV3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U3KQV3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms