Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W6

TDRKH, Tudor and KH domain-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRKHQ9Y2W6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRKHQ9Y2W6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRKHQ9Y2W6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRKHQ9Y2W6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRKHQ9Y2W6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TDRKHQ9Y2W6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TDRKHQ9Y2W6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TDRKHQ9Y2W6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TDRKHQ9Y2W6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDRKHQ9Y2W6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDRKHQ9Y2W6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDRKHQ9Y2W6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDRKHQ9Y2W6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDRKHQ9Y2W6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TDRKHQ9Y2W6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TDRKHQ9Y2W6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRKHQ9Y2W6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TDRKHQ9Y2W6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRKHQ9Y2W6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRKHQ9Y2W6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRKHQ9Y2W6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TDRKHQ9Y2W6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TDRKHQ9Y2W6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TDRKHQ9Y2W6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TDRKHQ9Y2W6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRKHQ9Y2W6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRKHQ9Y2W6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRKHQ9Y2W6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TDRKHQ9Y2W6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TDRKHQ9Y2W6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TDRKHQ9Y2W6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TDRKHQ9Y2W6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TDRKHQ9Y2W6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TDRKHQ9Y2W6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TDRKHQ9Y2W6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TDRKHQ9Y2W6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TDRKHQ9Y2W6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TDRKHQ9Y2W6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TDRKHQ9Y2W6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TDRKHQ9Y2W6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms