Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL20Q9Y2M5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL20Q9Y2M5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL20Q9Y2M5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL20Q9Y2M5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLHL20Q9Y2M5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL20Q9Y2M5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL20Q9Y2M5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL20Q9Y2M5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL20Q9Y2M5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms