Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NINLQ9Y2I6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NINLQ9Y2I6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
NINLQ9Y2I6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NINLQ9Y2I6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NINLQ9Y2I6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NINLQ9Y2I6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NINLQ9Y2I6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NINLQ9Y2I6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NINLQ9Y2I6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NINLQ9Y2I6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NINLQ9Y2I6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NINLQ9Y2I6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NINLQ9Y2I6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NINLQ9Y2I6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NINLQ9Y2I6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NINLQ9Y2I6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NINLQ9Y2I6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NINLQ9Y2I6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NINLQ9Y2I6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NINLQ9Y2I6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
NINLQ9Y2I6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NINLQ9Y2I6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NINLQ9Y2I6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NINLQ9Y2I6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
NINLQ9Y2I6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NINLQ9Y2I6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NINLQ9Y2I6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
NINLQ9Y2I6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NINLQ9Y2I6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NINLQ9Y2I6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NINLQ9Y2I6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NINLQ9Y2I6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NINLQ9Y2I6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NINLQ9Y2I6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NINLQ9Y2I6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NINLQ9Y2I6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NINLQ9Y2I6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NINLQ9Y2I6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
NINLQ9Y2I6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NINLQ9Y2I6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NINLQ9Y2I6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NINLQ9Y2I6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NINLQ9Y2I6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NINLQ9Y2I6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NINLQ9Y2I6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NINLQ9Y2I6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NINLQ9Y2I6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NINLQ9Y2I6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NINLQ9Y2I6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NINLQ9Y2I6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NINLQ9Y2I6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NINLQ9Y2I6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NINLQ9Y2I6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NINLQ9Y2I6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
NINLQ9Y2I6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
NINLQ9Y2I6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
NINLQ9Y2I6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NINLQ9Y2I6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NINLQ9Y2I6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NINLQ9Y2I6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NINLQ9Y2I6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NINLQ9Y2I6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NINLQ9Y2I6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NINLQ9Y2I6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NINLQ9Y2I6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NINLQ9Y2I6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NINLQ9Y2I6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
NINLQ9Y2I6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
NINLQ9Y2I6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
NINLQ9Y2I6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
NINLQ9Y2I6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NINLQ9Y2I6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NINLQ9Y2I6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NINLQ9Y2I6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NINLQ9Y2I6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NINLQ9Y2I6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NINLQ9Y2I6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NINLQ9Y2I6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NINLQ9Y2I6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
NINLQ9Y2I6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NINLQ9Y2I6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NINLQ9Y2I6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
NINLQ9Y2I6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NINLQ9Y2I6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NINLQ9Y2I6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NINLQ9Y2I6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
NINLQ9Y2I6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NINLQ9Y2I6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NINLQ9Y2I6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NINLQ9Y2I6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NINLQ9Y2I6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NINLQ9Y2I6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NINLQ9Y2I6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
NINLQ9Y2I6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms