Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIGD1AQ9Y241 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIGD1AQ9Y241 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIGD1AQ9Y241 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIGD1AQ9Y241 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIGD1AQ9Y241 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIGD1AQ9Y241 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIGD1AQ9Y241 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIGD1AQ9Y241 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIGD1AQ9Y241 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIGD1AQ9Y241 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIGD1AQ9Y241 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIGD1AQ9Y241 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIGD1AQ9Y241 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIGD1AQ9Y241 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIGD1AQ9Y241 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIGD1AQ9Y241 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIGD1AQ9Y241 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HIGD1AQ9Y241 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIGD1AQ9Y241 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HIGD1AQ9Y241 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIGD1AQ9Y241 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HIGD1AQ9Y241 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms