Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM9

B9D1, B9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B9D1Q9UPM9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
B9D1Q9UPM9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
B9D1Q9UPM9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
B9D1Q9UPM9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
B9D1Q9UPM9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
B9D1Q9UPM9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B9D1Q9UPM9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B9D1Q9UPM9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B9D1Q9UPM9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B9D1Q9UPM9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B9D1Q9UPM9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B9D1Q9UPM9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B9D1Q9UPM9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B9D1Q9UPM9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
B9D1Q9UPM9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B9D1Q9UPM9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
B9D1Q9UPM9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
B9D1Q9UPM9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B9D1Q9UPM9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B9D1Q9UPM9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B9D1Q9UPM9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
B9D1Q9UPM9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
B9D1Q9UPM9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B9D1Q9UPM9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B9D1Q9UPM9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B9D1Q9UPM9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B9D1Q9UPM9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
B9D1Q9UPM9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
B9D1Q9UPM9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B9D1Q9UPM9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B9D1Q9UPM9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
B9D1Q9UPM9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B9D1Q9UPM9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
B9D1Q9UPM9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms