Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCC3Q9ULS5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCC3Q9ULS5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCC3Q9ULS5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCC3Q9ULS5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCC3Q9ULS5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMCC3Q9ULS5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCC3Q9ULS5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMCC3Q9ULS5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMCC3Q9ULS5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCC3Q9ULS5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMCC3Q9ULS5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCC3Q9ULS5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCC3Q9ULS5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMCC3Q9ULS5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMCC3Q9ULS5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMCC3Q9ULS5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCC3Q9ULS5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCC3Q9ULS5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCC3Q9ULS5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCC3Q9ULS5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCC3Q9ULS5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCC3Q9ULS5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCC3Q9ULS5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCC3Q9ULS5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCC3Q9ULS5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCC3Q9ULS5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCC3Q9ULS5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCC3Q9ULS5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCC3Q9ULS5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCC3Q9ULS5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCC3Q9ULS5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCC3Q9ULS5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCC3Q9ULS5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCC3Q9ULS5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCC3Q9ULS5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCC3Q9ULS5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCC3Q9ULS5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCC3Q9ULS5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCC3Q9ULS5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCC3Q9ULS5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMCC3Q9ULS5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCC3Q9ULS5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCC3Q9ULS5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMCC3Q9ULS5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMCC3Q9ULS5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMCC3Q9ULS5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms