Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ9

PCOLCE2, Procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2Q9UKZ9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCOLCE2Q9UKZ9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCOLCE2Q9UKZ9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCOLCE2Q9UKZ9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCOLCE2Q9UKZ9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCOLCE2Q9UKZ9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCOLCE2Q9UKZ9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCOLCE2Q9UKZ9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCOLCE2Q9UKZ9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PCOLCE2Q9UKZ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCOLCE2Q9UKZ9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCOLCE2Q9UKZ9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCOLCE2Q9UKZ9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCOLCE2Q9UKZ9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCOLCE2Q9UKZ9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCOLCE2Q9UKZ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCOLCE2Q9UKZ9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCOLCE2Q9UKZ9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCOLCE2Q9UKZ9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCOLCE2Q9UKZ9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCOLCE2Q9UKZ9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCOLCE2Q9UKZ9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCOLCE2Q9UKZ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCOLCE2Q9UKZ9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms