Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
TNIKQ9UKE5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
TNIKQ9UKE5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
TNIKQ9UKE5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
TNIKQ9UKE5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TNIKQ9UKE5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TNIKQ9UKE5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC43.33■■■■■ 4.53
TNIKQ9UKE5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TNIKQ9UKE5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TNIKQ9UKE5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
TNIKQ9UKE5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
TNIKQ9UKE5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
TNIKQ9UKE5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
TNIKQ9UKE5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
TNIKQ9UKE5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
TNIKQ9UKE5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC43.29■■■■■ 4.52
TNIKQ9UKE5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
TNIKQ9UKE5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
TNIKQ9UKE5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
TNIKQ9UKE5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
TNIKQ9UKE5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
TNIKQ9UKE5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
TNIKQ9UKE5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
TNIKQ9UKE5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
TNIKQ9UKE5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
TNIKQ9UKE5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
TNIKQ9UKE5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
TNIKQ9UKE5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
TNIKQ9UKE5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
TNIKQ9UKE5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
TNIKQ9UKE5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
TNIKQ9UKE5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
TNIKQ9UKE5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
TNIKQ9UKE5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
TNIKQ9UKE5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
TNIKQ9UKE5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
TNIKQ9UKE5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
TNIKQ9UKE5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
TNIKQ9UKE5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
TNIKQ9UKE5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
TNIKQ9UKE5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
TNIKQ9UKE5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
TNIKQ9UKE5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
TNIKQ9UKE5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC43.15■■■■■ 4.5
TNIKQ9UKE5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
TNIKQ9UKE5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
TNIKQ9UKE5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
TNIKQ9UKE5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
TNIKQ9UKE5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
TNIKQ9UKE5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
TNIKQ9UKE5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
TNIKQ9UKE5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
TNIKQ9UKE5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
TNIKQ9UKE5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
TNIKQ9UKE5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
TNIKQ9UKE5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
TNIKQ9UKE5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
TNIKQ9UKE5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.48
TNIKQ9UKE5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
TNIKQ9UKE5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
TNIKQ9UKE5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
TNIKQ9UKE5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
TNIKQ9UKE5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
TNIKQ9UKE5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
TNIKQ9UKE5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
TNIKQ9UKE5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
TNIKQ9UKE5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
TNIKQ9UKE5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
TNIKQ9UKE5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
TNIKQ9UKE5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC42.99■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC42.98■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC42.96■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
TNIKQ9UKE5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
TNIKQ9UKE5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
TNIKQ9UKE5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
TNIKQ9UKE5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
TNIKQ9UKE5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
TNIKQ9UKE5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
TNIKQ9UKE5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.92■■■■■ 4.46
TNIKQ9UKE5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms