Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCNL1Q9UK58 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCNL1Q9UK58 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCNL1Q9UK58 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCNL1Q9UK58 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCNL1Q9UK58 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CCNL1Q9UK58 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCNL1Q9UK58 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCNL1Q9UK58 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCNL1Q9UK58 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCNL1Q9UK58 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCNL1Q9UK58 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCNL1Q9UK58 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCNL1Q9UK58 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCNL1Q9UK58 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCNL1Q9UK58 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCNL1Q9UK58 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCNL1Q9UK58 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCNL1Q9UK58 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCNL1Q9UK58 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCNL1Q9UK58 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCNL1Q9UK58 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCNL1Q9UK58 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCNL1Q9UK58 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCNL1Q9UK58 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CCNL1Q9UK58 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCNL1Q9UK58 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCNL1Q9UK58 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCNL1Q9UK58 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCNL1Q9UK58 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCNL1Q9UK58 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCNL1Q9UK58 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCNL1Q9UK58 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCNL1Q9UK58 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCNL1Q9UK58 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCNL1Q9UK58 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCNL1Q9UK58 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCNL1Q9UK58 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCNL1Q9UK58 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCNL1Q9UK58 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCNL1Q9UK58 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCNL1Q9UK58 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCNL1Q9UK58 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCNL1Q9UK58 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCNL1Q9UK58 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCNL1Q9UK58 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CCNL1Q9UK58 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCNL1Q9UK58 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCNL1Q9UK58 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCNL1Q9UK58 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCNL1Q9UK58 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCNL1Q9UK58 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCNL1Q9UK58 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CCNL1Q9UK58 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCNL1Q9UK58 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCNL1Q9UK58 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCNL1Q9UK58 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCNL1Q9UK58 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCNL1Q9UK58 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCNL1Q9UK58 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCNL1Q9UK58 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCNL1Q9UK58 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCNL1Q9UK58 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCNL1Q9UK58 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCNL1Q9UK58 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCNL1Q9UK58 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCNL1Q9UK58 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCNL1Q9UK58 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCNL1Q9UK58 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCNL1Q9UK58 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCNL1Q9UK58 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCNL1Q9UK58 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCNL1Q9UK58 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCNL1Q9UK58 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCNL1Q9UK58 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCNL1Q9UK58 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCNL1Q9UK58 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCNL1Q9UK58 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCNL1Q9UK58 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCNL1Q9UK58 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCNL1Q9UK58 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCNL1Q9UK58 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCNL1Q9UK58 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCNL1Q9UK58 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCNL1Q9UK58 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CCNL1Q9UK58 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CCNL1Q9UK58 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCNL1Q9UK58 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCNL1Q9UK58 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCNL1Q9UK58 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCNL1Q9UK58 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCNL1Q9UK58 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCNL1Q9UK58 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCNL1Q9UK58 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCNL1Q9UK58 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCNL1Q9UK58 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCNL1Q9UK58 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCNL1Q9UK58 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCNL1Q9UK58 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCNL1Q9UK58 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms