Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCTN4Q9UJW0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DCTN4Q9UJW0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCTN4Q9UJW0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DCTN4Q9UJW0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DCTN4Q9UJW0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DCTN4Q9UJW0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCTN4Q9UJW0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCTN4Q9UJW0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCTN4Q9UJW0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCTN4Q9UJW0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCTN4Q9UJW0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCTN4Q9UJW0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCTN4Q9UJW0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCTN4Q9UJW0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCTN4Q9UJW0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCTN4Q9UJW0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCTN4Q9UJW0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCTN4Q9UJW0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCTN4Q9UJW0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCTN4Q9UJW0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCTN4Q9UJW0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCTN4Q9UJW0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DCTN4Q9UJW0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCTN4Q9UJW0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCTN4Q9UJW0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCTN4Q9UJW0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCTN4Q9UJW0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCTN4Q9UJW0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCTN4Q9UJW0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCTN4Q9UJW0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCTN4Q9UJW0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCTN4Q9UJW0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DCTN4Q9UJW0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCTN4Q9UJW0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCTN4Q9UJW0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCTN4Q9UJW0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCTN4Q9UJW0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCTN4Q9UJW0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCTN4Q9UJW0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCTN4Q9UJW0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms