Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SCN11AQ9UI33 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SCN11AQ9UI33 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SCN11AQ9UI33 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SCN11AQ9UI33 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SCN11AQ9UI33 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SCN11AQ9UI33 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SCN11AQ9UI33 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SCN11AQ9UI33 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SCN11AQ9UI33 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SCN11AQ9UI33 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SCN11AQ9UI33 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SCN11AQ9UI33 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SCN11AQ9UI33 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SCN11AQ9UI33 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SCN11AQ9UI33 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SCN11AQ9UI33 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SCN11AQ9UI33 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SCN11AQ9UI33 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SCN11AQ9UI33 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SCN11AQ9UI33 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SCN11AQ9UI33 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SCN11AQ9UI33 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SCN11AQ9UI33 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SCN11AQ9UI33 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SCN11AQ9UI33 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SCN11AQ9UI33 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SCN11AQ9UI33 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SCN11AQ9UI33 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SCN11AQ9UI33 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCN11AQ9UI33 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SCN11AQ9UI33 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SCN11AQ9UI33 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SCN11AQ9UI33 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SCN11AQ9UI33 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SCN11AQ9UI33 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SCN11AQ9UI33 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SCN11AQ9UI33 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SCN11AQ9UI33 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SCN11AQ9UI33 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SCN11AQ9UI33 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCN11AQ9UI33 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCN11AQ9UI33 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCN11AQ9UI33 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SCN11AQ9UI33 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCN11AQ9UI33 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SCN11AQ9UI33 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SCN11AQ9UI33 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCN11AQ9UI33 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCN11AQ9UI33 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SCN11AQ9UI33 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCN11AQ9UI33 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SCN11AQ9UI33 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCN11AQ9UI33 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCN11AQ9UI33 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCN11AQ9UI33 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SCN11AQ9UI33 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCN11AQ9UI33 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCN11AQ9UI33 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SCN11AQ9UI33 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SCN11AQ9UI33 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SCN11AQ9UI33 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SCN11AQ9UI33 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCN11AQ9UI33 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCN11AQ9UI33 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCN11AQ9UI33 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCN11AQ9UI33 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCN11AQ9UI33 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SCN11AQ9UI33 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCN11AQ9UI33 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCN11AQ9UI33 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCN11AQ9UI33 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCN11AQ9UI33 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SCN11AQ9UI33 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SCN11AQ9UI33 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCN11AQ9UI33 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SCN11AQ9UI33 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SCN11AQ9UI33 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SCN11AQ9UI33 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms