Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
MLH3Q9UHC1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
MLH3Q9UHC1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
MLH3Q9UHC1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
MLH3Q9UHC1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
MLH3Q9UHC1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
MLH3Q9UHC1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
MLH3Q9UHC1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
MLH3Q9UHC1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
MLH3Q9UHC1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
MLH3Q9UHC1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
MLH3Q9UHC1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
MLH3Q9UHC1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
MLH3Q9UHC1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
MLH3Q9UHC1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
MLH3Q9UHC1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
MLH3Q9UHC1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
MLH3Q9UHC1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
MLH3Q9UHC1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
MLH3Q9UHC1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
MLH3Q9UHC1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
MLH3Q9UHC1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
MLH3Q9UHC1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
MLH3Q9UHC1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
MLH3Q9UHC1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
MLH3Q9UHC1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
MLH3Q9UHC1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
MLH3Q9UHC1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
MLH3Q9UHC1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
MLH3Q9UHC1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
MLH3Q9UHC1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
MLH3Q9UHC1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
MLH3Q9UHC1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
MLH3Q9UHC1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
MLH3Q9UHC1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
MLH3Q9UHC1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
MLH3Q9UHC1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
MLH3Q9UHC1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
MLH3Q9UHC1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
MLH3Q9UHC1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
MLH3Q9UHC1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
MLH3Q9UHC1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
MLH3Q9UHC1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
MLH3Q9UHC1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
MLH3Q9UHC1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
MLH3Q9UHC1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
MLH3Q9UHC1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
MLH3Q9UHC1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
MLH3Q9UHC1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
MLH3Q9UHC1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
MLH3Q9UHC1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40■■■■□ 3.99
MLH3Q9UHC1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
MLH3Q9UHC1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
MLH3Q9UHC1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
MLH3Q9UHC1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
MLH3Q9UHC1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
MLH3Q9UHC1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
MLH3Q9UHC1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
MLH3Q9UHC1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
MLH3Q9UHC1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
MLH3Q9UHC1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
MLH3Q9UHC1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC39.94■■■■□ 3.98
MLH3Q9UHC1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
MLH3Q9UHC1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
MLH3Q9UHC1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
MLH3Q9UHC1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
MLH3Q9UHC1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
MLH3Q9UHC1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
MLH3Q9UHC1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
MLH3Q9UHC1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
MLH3Q9UHC1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
MLH3Q9UHC1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
MLH3Q9UHC1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
MLH3Q9UHC1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.89■■■■□ 3.98
MLH3Q9UHC1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
MLH3Q9UHC1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
MLH3Q9UHC1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
MLH3Q9UHC1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
MLH3Q9UHC1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
MLH3Q9UHC1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
MLH3Q9UHC1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
MLH3Q9UHC1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
MLH3Q9UHC1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
MLH3Q9UHC1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
MLH3Q9UHC1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
MLH3Q9UHC1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
MLH3Q9UHC1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
MLH3Q9UHC1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
MLH3Q9UHC1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
MLH3Q9UHC1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
MLH3Q9UHC1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
MLH3Q9UHC1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
MLH3Q9UHC1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
MLH3Q9UHC1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
MLH3Q9UHC1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
MLH3Q9UHC1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
MLH3Q9UHC1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
MLH3Q9UHC1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
MLH3Q9UHC1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
MLH3Q9UHC1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms