Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMTOR3Q9UHA4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMTOR3Q9UHA4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LAMTOR3Q9UHA4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LAMTOR3Q9UHA4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms