Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS29Q9UBQ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS29Q9UBQ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS29Q9UBQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS29Q9UBQ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS29Q9UBQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS29Q9UBQ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS29Q9UBQ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS29Q9UBQ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS29Q9UBQ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS29Q9UBQ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS29Q9UBQ0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS29Q9UBQ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS29Q9UBQ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS29Q9UBQ0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS29Q9UBQ0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS29Q9UBQ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS29Q9UBQ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS29Q9UBQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS29Q9UBQ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS29Q9UBQ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS29Q9UBQ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS29Q9UBQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS29Q9UBQ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS29Q9UBQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS29Q9UBQ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS29Q9UBQ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS29Q9UBQ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS29Q9UBQ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS29Q9UBQ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS29Q9UBQ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS29Q9UBQ0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS29Q9UBQ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS29Q9UBQ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS29Q9UBQ0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS29Q9UBQ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS29Q9UBQ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS29Q9UBQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS29Q9UBQ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS29Q9UBQ0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS29Q9UBQ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS29Q9UBQ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS29Q9UBQ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS29Q9UBQ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS29Q9UBQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS29Q9UBQ0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS29Q9UBQ0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS29Q9UBQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS29Q9UBQ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS29Q9UBQ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS29Q9UBQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS29Q9UBQ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS29Q9UBQ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS29Q9UBQ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS29Q9UBQ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS29Q9UBQ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS29Q9UBQ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS29Q9UBQ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms