Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2L2Q9NZM6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKD2L2Q9NZM6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2L2Q9NZM6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKD2L2Q9NZM6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2L2Q9NZM6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2L2Q9NZM6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2L2Q9NZM6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2L2Q9NZM6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2L2Q9NZM6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKD2L2Q9NZM6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PKD2L2Q9NZM6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKD2L2Q9NZM6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2L2Q9NZM6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2L2Q9NZM6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2L2Q9NZM6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2L2Q9NZM6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2L2Q9NZM6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2L2Q9NZM6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2L2Q9NZM6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2L2Q9NZM6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2L2Q9NZM6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2L2Q9NZM6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKD2L2Q9NZM6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PKD2L2Q9NZM6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKD2L2Q9NZM6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2L2Q9NZM6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2L2Q9NZM6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2L2Q9NZM6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2L2Q9NZM6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2L2Q9NZM6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2L2Q9NZM6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2L2Q9NZM6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2L2Q9NZM6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PKD2L2Q9NZM6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms