Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VNN3Q9NY84 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VNN3Q9NY84 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VNN3Q9NY84 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VNN3Q9NY84 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VNN3Q9NY84 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VNN3Q9NY84 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VNN3Q9NY84 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VNN3Q9NY84 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VNN3Q9NY84 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VNN3Q9NY84 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VNN3Q9NY84 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VNN3Q9NY84 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VNN3Q9NY84 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VNN3Q9NY84 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VNN3Q9NY84 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VNN3Q9NY84 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VNN3Q9NY84 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms