Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PGPEP1Q9NXJ5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGPEP1Q9NXJ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PGPEP1Q9NXJ5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms