Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRMT1Q9NXH9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRMT1Q9NXH9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRMT1Q9NXH9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRMT1Q9NXH9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRMT1Q9NXH9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRMT1Q9NXH9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRMT1Q9NXH9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRMT1Q9NXH9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRMT1Q9NXH9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRMT1Q9NXH9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRMT1Q9NXH9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRMT1Q9NXH9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRMT1Q9NXH9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRMT1Q9NXH9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRMT1Q9NXH9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRMT1Q9NXH9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRMT1Q9NXH9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRMT1Q9NXH9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRMT1Q9NXH9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRMT1Q9NXH9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRMT1Q9NXH9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRMT1Q9NXH9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRMT1Q9NXH9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRMT1Q9NXH9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRMT1Q9NXH9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRMT1Q9NXH9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRMT1Q9NXH9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRMT1Q9NXH9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRMT1Q9NXH9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRMT1Q9NXH9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRMT1Q9NXH9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRMT1Q9NXH9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRMT1Q9NXH9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRMT1Q9NXH9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRMT1Q9NXH9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRMT1Q9NXH9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRMT1Q9NXH9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRMT1Q9NXH9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRMT1Q9NXH9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRMT1Q9NXH9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRMT1Q9NXH9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRMT1Q9NXH9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRMT1Q9NXH9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRMT1Q9NXH9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRMT1Q9NXH9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRMT1Q9NXH9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRMT1Q9NXH9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRMT1Q9NXH9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRMT1Q9NXH9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRMT1Q9NXH9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRMT1Q9NXH9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms