Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM39AQ9NV64 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMEM39AQ9NV64 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMEM39AQ9NV64 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMEM39AQ9NV64 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMEM39AQ9NV64 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM39AQ9NV64 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM39AQ9NV64 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMEM39AQ9NV64 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM39AQ9NV64 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM39AQ9NV64 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMEM39AQ9NV64 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM39AQ9NV64 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM39AQ9NV64 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM39AQ9NV64 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM39AQ9NV64 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM39AQ9NV64 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM39AQ9NV64 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM39AQ9NV64 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM39AQ9NV64 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMEM39AQ9NV64 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMEM39AQ9NV64 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM39AQ9NV64 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TMEM39AQ9NV64 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM39AQ9NV64 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM39AQ9NV64 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMEM39AQ9NV64 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM39AQ9NV64 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM39AQ9NV64 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMEM39AQ9NV64 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMEM39AQ9NV64 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM39AQ9NV64 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMEM39AQ9NV64 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM39AQ9NV64 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMEM39AQ9NV64 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM39AQ9NV64 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM39AQ9NV64 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMEM39AQ9NV64 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM39AQ9NV64 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM39AQ9NV64 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM39AQ9NV64 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMEM39AQ9NV64 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM39AQ9NV64 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM39AQ9NV64 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMEM39AQ9NV64 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM39AQ9NV64 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM39AQ9NV64 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM39AQ9NV64 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM39AQ9NV64 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM39AQ9NV64 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM39AQ9NV64 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM39AQ9NV64 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM39AQ9NV64 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM39AQ9NV64 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM39AQ9NV64 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM39AQ9NV64 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM39AQ9NV64 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM39AQ9NV64 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM39AQ9NV64 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMEM39AQ9NV64 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM39AQ9NV64 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM39AQ9NV64 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM39AQ9NV64 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMEM39AQ9NV64 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMEM39AQ9NV64 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM39AQ9NV64 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM39AQ9NV64 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM39AQ9NV64 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM39AQ9NV64 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM39AQ9NV64 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM39AQ9NV64 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM39AQ9NV64 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM39AQ9NV64 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM39AQ9NV64 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM39AQ9NV64 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM39AQ9NV64 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM39AQ9NV64 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM39AQ9NV64 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM39AQ9NV64 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM39AQ9NV64 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM39AQ9NV64 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM39AQ9NV64 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM39AQ9NV64 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms