Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF19AQ9NV58 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF19AQ9NV58 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF19AQ9NV58 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF19AQ9NV58 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF19AQ9NV58 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF19AQ9NV58 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF19AQ9NV58 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF19AQ9NV58 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF19AQ9NV58 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF19AQ9NV58 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF19AQ9NV58 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF19AQ9NV58 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF19AQ9NV58 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF19AQ9NV58 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF19AQ9NV58 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF19AQ9NV58 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF19AQ9NV58 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF19AQ9NV58 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF19AQ9NV58 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF19AQ9NV58 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF19AQ9NV58 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF19AQ9NV58 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RNF19AQ9NV58 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF19AQ9NV58 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RNF19AQ9NV58 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RNF19AQ9NV58 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RNF19AQ9NV58 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms