Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 CD44-204ENST00000279452 862 ntTSL 37.04□□□□□ -1.285e-38■■■■■ 698.7
UTP3Q9NQZ2 CD44-221ENST00000526000 722 ntTSL 57.02□□□□□ -1.295e-38■■■■■ 698.7
UTP3Q9NQZ2 CD44-202ENST00000278385 697 ntTSL 36.68□□□□□ -1.345e-38■■■■■ 698.7
UTP3Q9NQZ2 CD44-238ENST00000534296 863 ntTSL 35.54□□□□□ -1.525e-38■■■■■ 698.7
UTP3Q9NQZ2 CD44-226ENST00000527889 543 ntTSL 35.36□□□□□ -1.555e-38■■■■■ 698.7
UTP3Q9NQZ2 CD44-234ENST00000531873 584 ntTSL 34.9□□□□□ -1.635e-38■■■■■ 698.7
UTP3Q9NQZ2 CD44-212ENST00000524922 352 ntTSL 33.85□□□□□ -1.795e-38■■■■■ 698.7
UTP3Q9NQZ2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.221e-17■■■■■ 694
UTP3Q9NQZ2 LRRC45-203ENST00000581227 1145 ntTSL 522■■□□□ 1.111e-17■■■■■ 694
UTP3Q9NQZ2 LRRC45-204ENST00000582083 527 ntTSL 317.61■□□□□ 0.411e-17■■■■■ 694
UTP3Q9NQZ2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.922e-20■■■■■ 689.4
UTP3Q9NQZ2 ERO1B-203ENST00000366589 605 ntTSL 515.41■□□□□ 0.062e-56■■■■■ 689.4
UTP3Q9NQZ2 NSMCE1-209ENST00000565384 580 ntTSL 312.22□□□□□ -0.452e-56■■■■■ 689.4
UTP3Q9NQZ2 PPP2R3A-205ENST00000490467 1782 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.732e-17■■■■■ 683.2
UTP3Q9NQZ2 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.242e-17■■■■■ 683.2
UTP3Q9NQZ2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.498e-12■■■■■ 682.8
UTP3Q9NQZ2 RAB6B-202ENST00000460865 723 ntTSL 515.75■□□□□ 0.118e-12■■■■■ 682.8
UTP3Q9NQZ2 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.068e-12■■■■■ 682.8
UTP3Q9NQZ2 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.218e-12■■■■■ 682.8
UTP3Q9NQZ2 RAB6B-204ENST00000477759 586 ntTSL 512.46□□□□□ -0.418e-12■■■■■ 682.8
UTP3Q9NQZ2 RAB6B-207ENST00000543906 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.438e-12■■■■■ 682.8
UTP3Q9NQZ2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.473e-9■■■■■ 680.1
UTP3Q9NQZ2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 680.1
UTP3Q9NQZ2 TTC28-AS1-210ENST00000430525 524 ntTSL 415.28■□□□□ 0.043e-9■■■■■ 680.1
UTP3Q9NQZ2 TTC28-AS1-204ENST00000424161 556 ntTSL 414.4□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 680.1
UTP3Q9NQZ2 TTC28-AS1-202ENST00000417497 627 ntTSL 314.25□□□□□ -0.133e-9■■■■■ 680.1
UTP3Q9NQZ2 TTC28-AS1-211ENST00000430853 564 ntTSL 414.04□□□□□ -0.163e-9■■■■■ 680.1
UTP3Q9NQZ2 TTC28-AS1-217ENST00000452612 746 ntTSL 313.77□□□□□ -0.213e-9■■■■■ 680.1
UTP3Q9NQZ2 TTC28-AS1-218ENST00000453632 562 ntTSL 412.47□□□□□ -0.413e-9■■■■■ 680.1
UTP3Q9NQZ2 TTC28-AS1-214ENST00000435348 578 ntTSL 410.48□□□□□ -0.733e-9■■■■■ 680.1
UTP3Q9NQZ2 CEP250-207ENST00000425934 2156 ntTSL 515.29■□□□□ 0.044e-12■■■■■ 672
UTP3Q9NQZ2 CEP250-209ENST00000461386 2295 ntTSL 214.55□□□□□ -0.084e-12■■■■■ 672
UTP3Q9NQZ2 FAM171A2-202ENST00000588067 964 ntTSL 525.81■■□□□ 1.726e-28■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 MKNK2-203ENST00000585667 870 ntTSL 523.61■■□□□ 1.376e-28■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 AC069368.1-201ENST00000502574 1178 ntTSL 223.6■■□□□ 1.377e-10■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 PSRC1-208ENST00000429031 835 ntTSL 323.15■■□□□ 1.37e-55■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 FAM171A2-204ENST00000592560 758 ntTSL 223.1■■□□□ 1.296e-28■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.146e-28■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 PSRC1-210ENST00000471740 738 ntTSL 321.05■□□□□ 0.967e-55■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 SLC48A1-207ENST00000549243 577 ntTSL 320.82■□□□□ 0.926e-28■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.847e-55■■■■■ 670.8
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UTP3Q9NQZ2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.727e-55■■■■■ 670.8
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UTP3Q9NQZ2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.697e-55■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.677e-10■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.677e-55■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.667e-55■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 PSRC1-212ENST00000492431 1870 ntTSL 1 (best)18.77■□□□□ 0.67e-55■■■■■ 670.8
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UTP3Q9NQZ2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.217e-10■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 PSRC1-207ENST00000418914 1040 ntTSL 1 (best)16.33■□□□□ 0.27e-55■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 TAF4-202ENST00000436129 2440 ntTSL 216.3■□□□□ 0.26e-28■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.17e-10■■■■■ 670.8
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UTP3Q9NQZ2 ZNF430-202ENST00000594110 536 ntTSL 413.73□□□□□ -0.216e-28■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 TAF4-205ENST00000488539 645 ntTSL 513.64□□□□□ -0.236e-28■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 ZBTB39-201ENST00000300101 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.556e-28■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF430-206ENST00000599548 595 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.576e-28■■■■■ 670.8
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UTP3Q9NQZ2 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.986e-28■■■■■ 670.8
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UTP3Q9NQZ2 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.456e-28■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 SYNGAP1-214ENST00000636436 100 ntTSL 53.21□□□□□ -1.96e-28■■■■■ 670.8
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-207ENST00000538523 931 ntTSL 218.64■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 661.9
UTP3Q9NQZ2 PPP1R12C-204ENST00000586992 4141 nt17.23■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 658.1
UTP3Q9NQZ2 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 06e-7■■■■■ 653.1
UTP3Q9NQZ2 SALL2-207ENST00000614342 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.296e-7■■■■■ 653.1
UTP3Q9NQZ2 SALL2-204ENST00000546363 3094 ntTSL 212.12□□□□□ -0.476e-7■■■■■ 653.1
UTP3Q9NQZ2 SALL2-201ENST00000450879 3178 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.566e-7■■■■■ 653.1
UTP3Q9NQZ2 SALL2-206ENST00000613414 1566 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.696e-7■■■■■ 653.1
UTP3Q9NQZ2 ACCS-204ENST00000527346 3373 ntTSL 29.33□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 652.3
UTP3Q9NQZ2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.64e-8■■■■■ 652.1
UTP3Q9NQZ2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.823e-8■■■■■ 651.7
UTP3Q9NQZ2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.653e-8■■■■■ 651.7
UTP3Q9NQZ2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.643e-8■■■■■ 651.7
UTP3Q9NQZ2 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.043e-8■■■■■ 651.7
UTP3Q9NQZ2 MTHFR-207ENST00000418034 1034 ntTSL 321.51■■□□□ 1.031e-38■■■■■ 645.9
UTP3Q9NQZ2 MTHFR-219ENST00000642002 549 nt18.9■□□□□ 0.621e-38■■■■■ 645.9
UTP3Q9NQZ2 MTHFR-208ENST00000423400 479 ntTSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.581e-38■■■■■ 645.9
UTP3Q9NQZ2 MTHFR-209ENST00000431243 1116 ntTSL 1 (best)10.31□□□□□ -0.761e-38■■■■■ 645.9
UTP3Q9NQZ2 MTHFR-206ENST00000413656 398 ntTSL 1 (best)8.51□□□□□ -1.051e-38■■■■■ 645.9
UTP3Q9NQZ2 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.822e-9■■■■■ 644.1
UTP3Q9NQZ2 SLC39A11-208ENST00000579988 910 ntTSL 318.32■□□□□ 0.526e-35■■■■■ 642.8
UTP3Q9NQZ2 SH3PXD2A-204ENST00000420222 3251 ntTSL 216.3■□□□□ 0.26e-35■■■■■ 642.8
UTP3Q9NQZ2 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.146e-35■■■■■ 642.8
UTP3Q9NQZ2 SH3PXD2A-201ENST00000315994 5504 ntTSL 1 (best)14.88□□□□□ -0.036e-35■■■■■ 642.8
UTP3Q9NQZ2 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.726e-35■■■■■ 642.8
UTP3Q9NQZ2 STRN4-214ENST00000597021 582 ntTSL 314.77□□□□□ -0.057e-42■■■■■ 637.6
UTP3Q9NQZ2 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.087e-10■■■■■ 634.7
UTP3Q9NQZ2 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.497e-10■■■■■ 634.7
UTP3Q9NQZ2 OTUD4-203ENST00000455611 2498 ntTSL 53.02□□□□□ -1.937e-10■■■■■ 634.7
UTP3Q9NQZ2 TLN2-210ENST00000561322 249 ntTSL 525.92■■□□□ 1.742e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.692e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 PAOX-205ENST00000476834 1336 ntTSL 1 (best)25.37■■□□□ 1.652e-26■■■■■ 633.5
UTP3Q9NQZ2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.652e-26■■■■■ 633.5
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