RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430525.5

TTC28-AS1-210, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 524 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-210ENST00000430525 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.18■■■■□ 3.38
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.45■■■□□ 2.79
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ABCC9O60706 1549 aa32.37■■■□□ 2.77
TTC28-AS1-210ENST00000430525 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.83■■■□□ 2.53
TTC28-AS1-210ENST00000430525 NACADO15069 1562 aa30.63■■■□□ 2.49
TTC28-AS1-210ENST00000430525 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.49■■■□□ 2.47
TTC28-AS1-210ENST00000430525 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.34■■■□□ 2.45
TTC28-AS1-210ENST00000430525 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.27■■■□□ 2.44
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.22■■■□□ 2.43
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.42
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
TTC28-AS1-210ENST00000430525 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.98■■■□□ 2.39
TTC28-AS1-210ENST00000430525 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.86■■■□□ 2.37
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SCRIBQ14160 1630 aa29.59■■■□□ 2.33
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.48■■■□□ 2.31
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.27■■■□□ 2.28
TTC28-AS1-210ENST00000430525 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.13■■■□□ 2.25
TTC28-AS1-210ENST00000430525 NCAPD3P42695 1498 aa28.27■■■□□ 2.12
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SMARCA4P51532 1647 aa28.23■■■□□ 2.11
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.21■■■□□ 2.11
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SMARCA2P51531 1590 aa28.11■■■□□ 2.09
TTC28-AS1-210ENST00000430525 HMGXB3Q12766 1538 aa28.08■■■□□ 2.08
TTC28-AS1-210ENST00000430525 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.94■■■□□ 2.06
TTC28-AS1-210ENST00000430525 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.9■■■□□ 2.06
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ERCC6Q03468 1493 aa27.89■■■□□ 2.06
TTC28-AS1-210ENST00000430525 NESP48681 1621 aa27.85■■■□□ 2.05
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CUX2O14529 1486 aa27.83■■■□□ 2.04
TTC28-AS1-210ENST00000430525 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.75■■■□□ 2.03
TTC28-AS1-210ENST00000430525 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.64■■■□□ 2.01
TTC28-AS1-210ENST00000430525 WIZO95785 1651 aa27.61■■■□□ 2.01
TTC28-AS1-210ENST00000430525 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
TTC28-AS1-210ENST00000430525 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.54■■■□□ 2
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.43■■□□□ 1.98
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.41■■□□□ 1.98
TTC28-AS1-210ENST00000430525 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.96
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.21■■□□□ 1.95
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
TTC28-AS1-210ENST00000430525 WDR62O43379 1518 aa27.17■■□□□ 1.94
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CFTRP13569 1480 aa27.13■■□□□ 1.93
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.12■■□□□ 1.93
TTC28-AS1-210ENST00000430525 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.11■■□□□ 1.93
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PRDM2Q13029 1718 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC28-AS1-210ENST00000430525 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.91■■□□□ 1.9
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TOPBP1Q92547 1522 aa26.62■■□□□ 1.85
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
TTC28-AS1-210ENST00000430525 OSCARQ8IYS5 282 aa26.57■■□□□ 1.84
TTC28-AS1-210ENST00000430525 IFT140Q96RY7 1462 aa26.56■■□□□ 1.84
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TRIM41Q8WV44 630 aa26.56■■□□□ 1.84
TTC28-AS1-210ENST00000430525 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.53■■□□□ 1.84
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ABCC8Q09428 1581 aa26.52■■□□□ 1.84
TTC28-AS1-210ENST00000430525 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
TTC28-AS1-210ENST00000430525 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
TTC28-AS1-210ENST00000430525 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
TTC28-AS1-210ENST00000430525 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.28■■□□□ 1.8
TTC28-AS1-210ENST00000430525 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.28■■□□□ 1.8
TTC28-AS1-210ENST00000430525 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.28■■□□□ 1.8
TTC28-AS1-210ENST00000430525 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.27■■□□□ 1.8
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CHD1O14646 1710 aa26.27■■□□□ 1.8
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SOGA1O94964 1423 aa26.22■■□□□ 1.79
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CUX1P39880 1505 aa26.21■■□□□ 1.79
TTC28-AS1-210ENST00000430525 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.2■■□□□ 1.78
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ARHGEF11O15085 1522 aa26.18■■□□□ 1.78
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
TTC28-AS1-210ENST00000430525 FBLN2P98095 1184 aa26.11■■□□□ 1.77
TTC28-AS1-210ENST00000430525 WDR97A6NE52 1622 aa26.08■■□□□ 1.77
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.04■■□□□ 1.76
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.97■■□□□ 1.75
TTC28-AS1-210ENST00000430525 GRIN2BQ13224 1484 aa25.97■■□□□ 1.75
TTC28-AS1-210ENST00000430525 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PBRM1Q86U86 1689 aa25.96■■□□□ 1.75
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ARAP1Q96P48 1450 aa25.92■■□□□ 1.74
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.92■■□□□ 1.74
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
TTC28-AS1-210ENST00000430525 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.91■■□□□ 1.74
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.89■■□□□ 1.74
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.88■■□□□ 1.73
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SYNJ2O15056 1496 aa25.88■■□□□ 1.73
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SYNJ1O43426 1573 aa25.87■■□□□ 1.73
TTC28-AS1-210ENST00000430525 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.82■■□□□ 1.72
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TOP2BQ02880 1626 aa25.8■■□□□ 1.72
TTC28-AS1-210ENST00000430525 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.72
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ADAMTS12P58397 1594 aa25.66■■□□□ 1.7
TTC28-AS1-210ENST00000430525 GRIN2AQ12879 1464 aa25.65■■□□□ 1.7
TTC28-AS1-210ENST00000430525 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
TTC28-AS1-210ENST00000430525 CEP170Q5SW79 1584 aa25.6■■□□□ 1.69
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.57■■□□□ 1.68
TTC28-AS1-210ENST00000430525 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.56■■□□□ 1.68
TTC28-AS1-210ENST00000430525 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.55■■□□□ 1.68
TTC28-AS1-210ENST00000430525 NUP160Q12769 1436 aa25.55■■□□□ 1.68
TTC28-AS1-210ENST00000430525 SHROOM2Q13796 1616 aa25.48■■□□□ 1.67
TTC28-AS1-210ENST00000430525 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.31■■□□□ 1.64
TTC28-AS1-210ENST00000430525 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TTC28-AS1-210ENST00000430525 JPH4Q96JJ6 628 aa25.3■■□□□ 1.64
TTC28-AS1-210ENST00000430525 IGF1RP08069 1367 aa25.27■■□□□ 1.64
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