RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435348.5

TTC28-AS1-214, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 578 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-214ENST00000435348 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.12■■■■□ 3.05
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FOXD1Q16676 465 aa29.01■■■□□ 2.23
TTC28-AS1-214ENST00000435348 POTEDQ86YR6 584 aa27.26■■□□□ 1.95
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MSH5O43196 834 aa27.13■■□□□ 1.93
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.01■■□□□ 1.91
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ADRA2BP18089 450 aa26.76■■□□□ 1.87
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.27■■□□□ 1.64
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.53■■□□□ 1.52
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.7■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ABCC9O60706 1549 aa23.54■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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TTC28-AS1-214ENST00000435348 RNF39Q9H2S5 420 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.97■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-214ENST00000435348 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.66■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.18■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-214ENST00000435348 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NACADO15069 1562 aa21.85■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DCAF8L2P0C7V8 631 aa21.72■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-214ENST00000435348 KCNA4P22459 653 aa21.66■■□□□ 1.06
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TTC28-AS1-214ENST00000435348 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.6■■□□□ 1.05
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CAPN15O75808 1086 aa21.6■■□□□ 1.05
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SLC4A2P04920 1241 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC28-AS1-214ENST00000435348 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.44■■□□□ 1.02
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.3■■□□□ 1
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.27■■□□□ 1
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TTC28-AS1-214ENST00000435348 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.22■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.18■□□□□ 0.98
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.15■□□□□ 0.98
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TTC28-AS1-214ENST00000435348 APLP2Q06481 763 aa20.99■□□□□ 0.95
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TTC28-AS1-214ENST00000435348 CUX2O14529 1486 aa20.56■□□□□ 0.88
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TTC28-AS1-214ENST00000435348 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.3■□□□□ 0.84
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TTC28-AS1-214ENST00000435348 AKT1S1Q96B36 256 aa20■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZBTB22O15209 634 aa19.99■□□□□ 0.79
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TTC28-AS1-214ENST00000435348 HMGXB3Q12766 1538 aa19.97■□□□□ 0.79
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TTC28-AS1-214ENST00000435348 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-214ENST00000435348 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SMARCA4P51532 1647 aa19.86■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-214ENST00000435348 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-214ENST00000435348 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.84■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PIP4P2Q8N4L2 257 aa19.78■□□□□ 0.76
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TTC28-AS1-214ENST00000435348 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PITPNM1O00562 1244 aa19.7■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.62■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.6■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP19.59■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ATXN8OSP0DMR3 200 aa19.58■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-214ENST00000435348 WDR62O43379 1518 aa19.55■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.53■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.45■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-214ENST00000435348 HAX1O00165 279 aa19.45■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SPDYE2BA6NHP3 402 aa19.38■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SPDYE6P0CI01 402 aa19.38■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
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